典型文献
基于重测序数据的昌都黑山羊遗传多样性及群体结构分析
文献摘要：
藏山羊是中国独特的地方品种.为进一步从基因组水平上了解藏山羊的遗传多样性及群体遗传结构,该研究对西藏昌都黑山羊的3个不同地方群体进行了全基因组重测序.鉴定3个采样群体的SNP位点结果表明,共鉴定出13426331个SNP位点;遗传多样性及连锁不平衡分析结果显示,3个采样群体的核苷酸多样性相近,并且LD衰减曲线相似;通过NJ进化树分析,其拓扑结构显示3个采样群体聚成1支,与西藏地区其它8个山羊品种或群体显著分离;群体结构分析结果显示,采样群体间亚群组成较为一致,但有2个采样群体存在一定的杂交特征;主成分分析显示,3个采样群体与其他西藏山羊品种或群体在前2个主成分上分离,位置及相互关系符合进化树结构以及群体结构结果.该研究从基因组水平解释了昌都黑山羊的种质特性,也为后续藏山羊种质资源保护和利用、重要经济性状的基因定位以及分子育种提供重要的理论依据.
文献关键词：
藏山羊;遗传多样性;全基因组重测序;群体结构
中图分类号：
作者姓名：
阿旺措吉;仁青措姆;黄舒泓;周先辉;德吉;索朗达;王小龙;吴玉江;巴贵
作者机构：
西藏自治区农牧科学院畜牧兽医研究所,西藏拉萨850000;西北农林科技大学动物科技学院,陕西杨凌712100
文献出处：
引用格式：
[1]阿旺措吉;仁青措姆;黄舒泓;周先辉;德吉;索朗达;王小龙;吴玉江;巴贵-.基于重测序数据的昌都黑山羊遗传多样性及群体结构分析)[J].家畜生态学报,2022(10):30-35
A类：
藏山羊,西藏山羊
B类：
序数,黑山羊,遗传多样性,群体结构分析,地方品种,群体遗传结构,西藏昌都,全基因组重测序,SNP,连锁不平衡分析,核苷酸多样性,性相近,LD,衰减曲线,曲线相似,NJ,进化树分析,拓扑结构,西藏地区,群体间,亚群组,树结构,种质特性,种质资源保护,保护和利用,重要经济性状,基因定位,分子育种
AB值：
0.264871
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