典型文献
基于线粒体DNA$D-loop区序列分析中国及新西兰奶山羊遗传进化关系
文献摘要:
[目的]分析我国地方培育奶山羊品种与国外引进品种的遗传进化关系.[方法]以4个国内奶山羊品种(文登奶山羊、关中奶山羊、崂山奶山羊、雅安奶山羊)和3个新西兰引进奶山羊品种(阿尔卑斯奶山羊、吐根堡奶山羊、萨能奶山羊)为研究对象,采集33只个体的外周血样本,提取血液基因组DNA,利用PCR法扩增线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)D-loop区全长序列,对测序获得的序列进行生物信息学分析,探究不同奶山羊品种的遗传多样性及进化关系.[结果]7个品种奶山羊的mtDNA D-loop区中A、T碱基含量高于G、C碱基含量.共检测到82个多态位点,25个单一多态位点,55个简约信息位点.各品种单倍型多样度(Hd)范围为0.905~1.000,核苷酸多样度(Pi)范围为0.00151~0.01332;共存在26种单倍型,文登奶山羊和萨能奶山羊各有5个单倍型,阿尔卑斯奶山羊有4个单倍型,崂山奶山羊、吐根堡奶山羊、关中奶山羊、雅安奶山羊各有3个单倍型;各品种核苷酸平均差异数(KXY)范围为6.40000~38.45000,核苷酸歧异度(DXY)范围为0.00579~0.03476,遗传分化系数(GST)范围为0.00000~0.18605,遗传分化指数(FST)范围为0.23156~0.97152.品种间系统发育树表明,文登奶山羊和崂山奶山羊聚为一支;关中奶山羊与3种新西兰奶山羊遗传距离较近,从遗传学角度证实了关中奶山羊由国外奶山羊与地方品种经杂交选育而成;雅安奶山羊与其他品种遗传距离最远.[结论]中国奶山羊存在2个支系起源且未发现群体扩张;中国培育奶山羊品种含有较多的国外奶山羊血统;文登奶山羊与崂山奶山羊亲缘关系较近,雅安奶山羊在遗传进化中可能存在地域隔离.
文献关键词:
奶山羊;线粒体DNA;D-loop区;遗传进化
中图分类号:
作者姓名:
苏少锋;孟子琪;王超;赵俊利;郝宸昉;赵启南
作者机构:
内蒙古自治区农牧业科学院,内蒙古 呼和浩特 010031
文献出处:
引用格式:
[1]苏少锋;孟子琪;王超;赵俊利;郝宸昉;赵启南-.基于线粒体DNA$D-loop区序列分析中国及新西兰奶山羊遗传进化关系)[J].畜牧与饲料科学,2022(03):64-72
A类:
文登奶山羊,吐根,KXY,DXY
B类:
loop,序列分析,新西兰,遗传进化,进化关系,引进品种,关中奶山羊,崂山,雅安,阿尔卑斯,萨能奶山羊,血样,mitochondrial,mtDNA,全长,生物信息学分析,遗传多样性,碱基,多态位点,一多,简约,单倍型,Hd,Pi,平均差,异数,歧异,遗传分化,GST,FST,种间,系统发育树,遗传距离,遗传学,地方品种,杂交选育,最远,支系,羊血,血统,亲缘关系
AB值:
0.194551
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