典型文献
基于生物信息学分析泛癌中PDPN的表达与预后及与免疫细胞浸润的关系
文献摘要：
目的:探讨平足蛋白(Podoplanin,PDPN)在泛癌中的表达量与预后及PDPN与免疫浸润之间的关系,为癌症的免疫治疗提供一个新的方向.方法:通过UACLAN、Oncomine和TIMER2.0数据库分析PDPN在泛癌及对应的正常组织中的表达量;通过PrognoScan和Kaplan-Meier Plotter数据库分析并验证PDPN与泛癌预后之间的相关性.通过TIMER2.0分析PDPN与不同类型癌症尤其是消化道肿瘤中免疫细胞浸润的相关性.在LinkedOmics以及DAVID、KOBAS数据库中查找与PDPN共表达的基因,并以此检索相关信号通路.STRING数据库寻找并分析PDPN互作的蛋白质.结果:PDPN在大多数癌组织中表达量增加,起到促癌基因的作用,部分癌组织中,PDPN表达量下降,仍可导致恶性肿瘤进展;PDPN表达量的高低与某些恶性肿瘤预后具有显著相关性;PDPN与多种免疫细胞尤其是肿瘤相关成纤维细胞(CAF)之间表现出显著的相关性,提示PDPN与肿瘤免疫浸润相关,可能参与肿瘤微环境的调控.PDPN参与调控多种信号通路.PDPN与CD44及CLEC1B之间存在较强的相互作用.结论:PDPN可以作为泛癌尤其是胃癌、结直肠癌等消化道肿瘤的预后生物标志物.PDPN在多种免疫细胞中表达,通过调节免疫浸润影响恶性肿瘤的进展.
文献关键词：
PDPN;预后;免疫浸润;癌症;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
袁明洁;刘端瑞;郏雁飞;宿振国;刘相东
作者机构：
滨州医学院,山东烟台 264000;山东大学附属济南市中心医院检验科,山东济南 250012;山东第一医科大学附属济南市中心医院检验科,山东济南 250012;滨州医学院烟台附属医院检验科,山东烟台 264100;山东第一医科大学附属省立医院检验科,山东济南 256200
文献出处：
引用格式：
[1]袁明洁;刘端瑞;郏雁飞;宿振国;刘相东-.基于生物信息学分析泛癌中PDPN的表达与预后及与免疫细胞浸润的关系)[J].医学检验与临床,2022(03):5-13,20
A类：
UACLAN,CLEC1B
B类：
生物信息学分析,泛癌,PDPN,免疫细胞浸润,讨平,平足蛋白,Podoplanin,免疫治疗,Oncomine,TIMER2,数据库分析,正常组织,PrognoScan,Kaplan,Meier,Plotter,消化道肿瘤,LinkedOmics,DAVID,KOBAS,共表达,STRING,癌组织,组织中表达,促癌基因,肿瘤进展,肿瘤预后,显著相关性,肿瘤相关成纤维细胞,CAF,肿瘤免疫浸润,肿瘤微环境,CD44,胃癌,结直肠癌,预后生物标志物,调节免疫
AB值：
0.286418
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