典型文献
肿瘤突变负荷与肿瘤浸润性免疫细胞在结直肠癌预后及进展中的作用
文献摘要：
目的:本文旨在通过分析结直肠癌(colorectal cancer,CRC)中肿瘤突变负荷(tumor mutational burden,TMB)、肿瘤浸润性免疫细胞(tumor-infiltrating immune cells,TICs)及临床病理特征三者之间的相互关系,探讨TMB及TICs在CRC进展中的相互作用及临床意义.方法:下载癌症基因组(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中CRC患者的相关数据,包括肿瘤突变、基因表达及相关临床信息等.利用R语言分别计算每个肿瘤样本的TMB值及TICs百分比,并分析TMB值及TICs百分比与临床病理参数和5年总生存率的相关性.根据TMB中位值将肿瘤样本分成高TMB组(n=224)和低TMB组(n=246),比较2组5年总生存率.筛选出差异表达基因和差异表达TICs,通过基因本体论(Gene Ontology,GO)、京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)及基因集富集分析(Gene Set Enrichment Analysis,GSEA)寻找其潜在相关的免疫机制和功能.结果:根据TCGA数据,>65岁CRC患者的TMB值更高,发生血管及淋巴结转移的肿瘤TMB值较低(P<0.001).与低TMB组相比,高TMB组CRC患者的5年总生存率更低(P<0.05).116个差异表达基因主要涉及药物代谢及白细胞跨内皮迁移信号通路;4种差异表达的TICs为CD4+T细胞、滤泡辅助性T细胞、M0及M1巨噬细胞.结论:TMB是一个重要的评价CRC预后和免疫治疗的指标,可以通过与TICs相互作用调节免疫微环境,从而影响CRC预后及免疫治疗的效果.
文献关键词：
肿瘤突变负荷;肿瘤浸润性免疫细胞;肿瘤微环境;结直肠癌
中图分类号：
作者姓名：
时姗姗;李霄;丁颖;宋国新;张智弘
作者机构：
南京医科大学第一附属医院病理科,南京 210029
文献出处：
引用格式：
[1]时姗姗;李霄;丁颖;宋国新;张智弘-.肿瘤突变负荷与肿瘤浸润性免疫细胞在结直肠癌预后及进展中的作用)[J].临床与病理杂志,2022(07):1543-1551
A类：
B类：
肿瘤突变负荷,肿瘤浸润性免疫细胞,结直肠癌,colorectal,cancer,CRC,tumor,mutational,burden,TMB,infiltrating,immune,cells,TICs,临床病理特征,下载,癌症基因,Cancer,Atlas,TCGA,临床信息,临床病理参数,总生存率,中位值,出差,差异表达基因,基因本体论,Ontology,京都基因与基因组百科全书,Kyoto,Encyclopedia,Genes,Genomes,基因集富集分析,Set,Enrichment,Analysis,GSEA,免疫机制,管及,淋巴结转移,药物代谢,跨内皮迁移,种差,CD4+T,滤泡,辅助性,M0,M1,巨噬细胞,免疫治疗,调节免疫,免疫微环境,肿瘤微环境
AB值：
0.305008
相似文献
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
