典型文献
猪流行性腹泻病毒云南省流行毒株S1基因序列分析
文献摘要：
为深入了解云南省猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)的流行现状及现有疫苗株的保护效果,从2017—2022年云南省PEDV感染临床阳性样品中扩增出9份样品的PEDV S1基因,利用生物信息学方法,对9份样品S1基因进行了遗传进化树构建、同源性分析和氨基酸突变位点分析等.结果显示:2份样品位于G1基因群,其余7份位于G2基因群的G2b基因亚群.7份G2b基因亚群样品的核苷酸和推导氨基酸同源性较高,与G2基因群的AJ1102和L/W/L疫苗株处于不同基因亚群且同源性较低,并在第13、139、289和363位发生了不一致的突变位点;与现有疫苗株相比,在抗原中和位点COE区域以及其他区域,有明显的抗原性变化.结果表明:云南省存在G1基因群和G2b基因亚群PEDV同时流行,但以G2b基因亚群为主;流行株和疫苗株间存在较远的遗传和亲缘关系,以及氨基酸突变和抗原性差异,这很可能是导致目前PED控制不理想的原因,因此需要研发安全有效的疫苗.
文献关键词：
猪流行性腹泻病毒;S1基因;序列分析;疫苗株
中图分类号：
作者姓名：
王鑫文;吴静楠;郭红瑞;张松梅;邓成松;鲁金强;邹丰才;张以芳;柴俊
作者机构：
云南农业大学动物医学院,云南昆明 650201;德宏州尚善品味农业有限公司,云南梁河 679200
文献出处：
引用格式：
[1]王鑫文;吴静楠;郭红瑞;张松梅;邓成松;鲁金强;邹丰才;张以芳;柴俊-.猪流行性腹泻病毒云南省流行毒株S1基因序列分析)[J].中国动物检疫,2022(09):18-25
A类：
G2b,AJ1102
B类：
猪流行性腹泻病毒,流行毒株,S1,基因序列分析,porcine,epidemic,diarrhea,virus,PEDV,流行现状,疫苗株,保护效果,利用生物,生物信息学方法,遗传进化树,进化树构建,同源性分析,氨基酸突变,突变位点,品位,G1,亚群,COE,抗原性,较远,和亲,亲缘关系
AB值：
0.217174
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