典型文献
2018-2020年豫南地区猪流行性腹泻病毒的遗传变异分析
文献摘要：
为分析2018-2020年豫南地区猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)的分子遗传变异情况,本研究利用RT-PCR方法从18个猪场PEDV感染仔猪组织中扩增S1基因部分片段、ORF3基因和N基因,进行核苷酸序列测定,并将PEDV流行株S1基因部分序列、ORF3基因和N基因推导氨基酸序列与参考毒株进行进化树构建与遗传变异分析.测序结果表明,18个猪场存在5株PEDV流行毒株.S1基因部分片段与N基因推导氨基酸进化树与相似性结果表明,5株PEDV流行株与已发表的2010年以后流行株组成G2群,与CV777株为代表的G1群毒株相似性分别为93.0％～96.7％和95.0％～96.8％.ORF3基因推导氨基酸进化树与相似性结果表明,5株PEDV流行株同其他非基因缺失毒株组成G2群,并分别属于G2a(HNXC和HNHC株)和G2c亚群(HNHB、HN-NY和HNZY株),与缺失毒株组成G1群毒株的相似性为88.0％～92.4％,与CV777毒株所在G2b亚群毒株相似性分别为94.7％～96.4％和94.7％～96.9％.氨基酸遗传变异分析结果表明,与经典毒株CV777相比较,5株PEDV流行株的S1部分氨基酸、ORF3氨基酸和N氨基酸分别存在10,5,10个位置发生相同氨基酸置换,以及分别有16,10,14个位置氨基酸不同程度的突变,此外,5株PEDV流行株ORF3氨基酸不存在缺失,具有PEDV强毒株的分子遗传特征.综上所述,豫南地区PEDV流行具有PEDV变异毒株及强毒株的分子遗传特征,可为该地区PED的防控提供理论指导.
文献关键词：
猪流行性腹泻病毒;S基因;ORF3基因;N基因;遗传变异分析
中图分类号：
作者姓名：
曲哲会;张喜文;董建国;刘涛;赵云焕;郭晓秋;李颖;许琬雪;李盼盼;李卓燕
作者机构：
信阳农林学院牧医工程学院,河南信阳464000;河南省大别山区生态畜禽健康生产工程研究中心,河南信阳464000;信阳市畜禽养殖与环境控制重点实验室,河南信阳464000
文献出处：
引用格式：
[1]曲哲会;张喜文;董建国;刘涛;赵云焕;郭晓秋;李颖;许琬雪;李盼盼;李卓燕-.2018-2020年豫南地区猪流行性腹泻病毒的遗传变异分析)[J].中国兽医学报,2022(10):1934-1941
A类：
分子遗传变异,G2a,HNXC,HNHC,G2c,HNHB,HNZY,G2b
B类：
豫南地区,猪流行性腹泻病毒,遗传变异分析,porcine,epidemic,diarrhea,virus,PEDV,变异情况,研究利用,猪场,仔猪,S1,分片,ORF3,序列测定,基因推导,氨基酸序列,进化树构建,流行毒株,CV777,G1,基因缺失,亚群,NY,别存,个位,遗传特征,综上所述,变异毒株
AB值：
0.172634
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