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2020-2021年河南省猪流行性腹泻病毒流行株遗传进化及S蛋白变异分析
文献摘要：
2020-2021年在河南省18个地区共收集499份发生腹泻的仔猪临床样品,采用RT-PCR进行猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)筛查.结果显示,共检测出162份阳性样品,阳性率为35.2％.对其中21株PEDV流行毒株S基因进行了测序、同源性比对和遗传进化分析,结果显示21株PEDV流行毒株之间核苷酸同源性为96.9％～100％,氨基酸同源性为95.2％～100％.与52株2011-2019年国内流行毒株之间的核苷酸同源性为95.1％～99.5％,氨基酸同源性为91％～99.8％.遗传进化结果显示,21株PEDV毒株均属于GⅡ b群.氨基酸序列比对显示,流行毒株S蛋白存在7处新的且规律的氨基酸突变.本试验对现阶段我国所流行的PEDVS基因进行测序分析,为了解PEDV流行毒株遗传变异趋势和研发新的有效疫苗提供参考.
文献关键词：
猪流行性腹泻病毒;河南省;S基因;遗传进化
中图分类号：
作者姓名：
郭子仪;许夕雅;邓梦梦;丁晨梦;高冬生;王永生;陈陆;阴文奇
作者机构：
河南农业大学动物医学院,河南 郑州450046;四川省畜牧科学研究院,四川成都610066
文献出处：
引用格式：
[1]郭子仪;许夕雅;邓梦梦;丁晨梦;高冬生;王永生;陈陆;阴文奇-.2020-2021年河南省猪流行性腹泻病毒流行株遗传进化及S蛋白变异分析)[J].中国兽医学报,2022(07):1335-1342
A类：
PEDVS
B类：
猪流行性腹泻病毒,变异分析,共收,仔猪,porcine,epidemic,diarrhea,virus,流行毒株,同源性,遗传进化分析,内流,氨基酸序列比对,氨基酸突变,测序分析,遗传变异
AB值：
0.163667
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