为了解湖北地区猪流行性腹泻病毒(PEDV)的流行特征及变异情况.2021年3月-2022年2月,从湖北地区共收集腹泻症状的粪便-肛门棉拭子1580份,采用双重巢式PCR法进行检测,分析不同养殖阶段、季节间的感染差异;并选取部分阳性样品进行PEDV-N基因的扩增与遗传进化分析.1580份样品共检出阳性样品318份,阳性率为20.13％(318/1580).其中0～28 d仔猪、28～70 d保育猪、70～120 d后备猪、120～270 d中大猪和>270 d猪只的阳性率分别为40.27％、26.89％、10.33％、8.07％和5.50％.冬季为PEDV感染的高发期(36.66％),其次是春季(19.00％)和秋季(11.49％),夏季(5.55％)的检出率相对较低.将部分阳性样品进行PEDV-N基因测序,随机挑选12株测序序列与24株参考株进行遗传进化分析,测序序列间N基因的核苷酸同源性为94.0％～99.7％,氨基酸同源性为93.9％～100.0％;测序序列与参考毒株的核苷酸同源性为94.5％～99.8％,氨基酸同源性为94.6％～100.0％.通过系统性发育进化树分析,PEDV流行株可分为三个亚型,G1-a、G1-b和G2-a型,其中2株属于G1-a型,1株属于G1-b型,其余均属于G2-a型.本研究结果为明确PEDV在湖北地区的流行特点及变异情况提供了参考依据.

猪流行性腹泻病毒;流行病学;序列分析

王妍;赵润泽;谭旭;张子微;李桐;李春琪;郭利伟;杨小林;刘国平

长江大学,荆州434000

中国动物传染病学报

[1]王妍;赵润泽;谭旭;张子微;李桐;李春琪;郭利伟;杨小林;刘国平-.湖北地区猪流行性腹泻病毒流行病学调查及N基因的序列分析)[J].中国动物传染病学报,2022(04):135-143

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