典型文献
江苏地区猪流行性腹泻流行病学调查及病原S基因序列分析
文献摘要：
为探究江苏省内猪场猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)的流行和遗传变异情况,采集江苏省13个地级市规模猪 场和屠宰场健康猪群的鼻拭子和肛拭子样品,通过RT-PCR方法检测PEDV,并对部分阳性样品进行S基因序列扩增、测序及遗传进化分析.结果显示:259份猪鼻拭子样品中,PEDV阳性检出率为10.42％(27/259);178份猪肛拭子样品中,PEDV阳性检出率为9.55％(17/178).选取的8株PEDV代表株的核苷酸序列同源性在99.2％～100％之间,氨基酸序列同源性在95.2％～97.1％之间,与国内流行毒株SD-M、JS2008的同源性最高,核苷酸序列同源性达到97％以上;遗传进化分析显示,8株PEDV代表株属于同一群,与经典毒株CV777、DR13亲缘关系较近.本研究初步明确了江苏地区健康猪群中猪流行性腹泻流行状况和PEDV遗传演化特点,为有效防控猪流行性腹泻提供参考.
文献关键词：
猪流行性腹泻病毒;S基因;流行病学调查;RT-PCR
中图分类号：
作者姓名：
李云锋;段滢;梁淳;李昱辰;姜瑜琦;李建达;刘朋;王文骞;杨诚洁;杨倩
作者机构：
南京农业大学,江苏南京 210095
文献出处：
引用格式：
[1]李云锋;段滢;梁淳;李昱辰;姜瑜琦;李建达;刘朋;王文骞;杨诚洁;杨倩-.江苏地区猪流行性腹泻流行病学调查及病原S基因序列分析)[J].畜牧与兽医,2022(05):90-97
A类：
JS2008
B类：
江苏地区,泻流,流行病学调查,基因序列分析,猪场,猪流行性腹泻病毒,porcine,epidemic,diarrhea,virus,PEDV,遗传变异,变异情况,地级市,屠宰场,健康猪,猪群,鼻拭子,肛拭子,子样,遗传进化分析,猪鼻,阳性检出率,代表株,序列同源性,氨基酸序列,内流,流行毒株,一群,CV777,DR13,亲缘关系,中猪,流行状况,遗传演化,演化特点
AB值：
0.289232
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