典型文献
FOLFOX耐药相关基因是预测结肠癌患者预后的潜在生物标志物
文献摘要:
目的 探索结肠癌对FOLFOX化疗方案耐药的关键机制.方法 综合GEO数据库中FOL-FOX 化疗方案相关数据集,合并后筛选差异表达基因,随机森林树提取特征基 因作为 耐药核心基因,评估其与临床药物的敏感性关系.共识聚类区分耐药核心基因的亚型及亚型的差异基因集,构建基于TCGA和GSE29621数据的风险模型,评估耐药核心基因与患者临床病理特征和预后的联系.结果 随机森林树筛选出来的耐药核心基因的表达水平能明显将对FOLFOX化疗方案反应与否的患者区分开来.分型结果显示主要的耐药原因为免疫浸润,使用耐药相关基因构建的风险模型比常规TNM分期更能预测患者的预后,且高低风险组患者的免疫浸润程度和免疫细胞水平具有明显差异.结论 FOLFOX化疗耐药与结肠癌患者的免疫浸润密切相关,耐药相关基因构建的风险模型能较好预测患者的临床病理转归和预后.
文献关键词:
FOLFOX;结肠癌;预后模型;耐药;肿瘤免疫;生物信息学
中图分类号:
作者姓名:
陈曙冉;董锐;吴华彰;刘牧林
作者机构:
蚌埠医学院第一附属医院胃肠外科,安徽蚌埠233000;蚌埠医学院生命科学学院癌症转化医学安徽省重点实验室,安徽蚌埠233000
文献出处:
引用格式:
[1]陈曙冉;董锐;吴华彰;刘牧林-.FOLFOX耐药相关基因是预测结肠癌患者预后的潜在生物标志物)[J].重庆医学,2022(17):3016-3024
A类:
GSE29621
B类:
FOLFOX,结肠癌患者,潜在生物标志物,化疗方案,关键机制,GEO,差异表达基因,提取特征,特征基,核心基因,临床药物,差异基因,TCGA,风险模型,临床病理特征,开来,免疫浸润,TNM,低风险组,浸润程度,免疫细胞水平,化疗耐药,转归,预后模型,肿瘤免疫
AB值:
0.241852
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