典型文献
极小种群馨香玉兰特异性单核苷酸多态性位点开发
文献摘要：
在馨香玉兰全基因组范围内进行特异性单核苷酸多态性(SNP)位点开发,为馨香玉兰濒危保护以及资源利用提供理论依据.利用以云南省5个野生居群和2个栽培居群共70个个体为材料,进行简化基因组测序技术(SLAF-seq),成功开发了 843 082个用于馨香玉兰SLAF建库的标签,其中多态性SLAF标记有287 843个,通过数据质控,共获得了 180 650个高度一致性的群体SNP位点,利用SNP位点对馨香玉兰居群进行遗传多样性分析,结果显示:馨香玉兰的观测杂合度4为0.269 7,期望杂合度He为0.335 5,Shannon指数为0.506 9,Nei多样性指数为0.355 3.结果表明,利用SLAF-seq技术能够实现全基因组范围内的大量SNP标记位点开发,利用大量的SNP位点解析物种的遗传多样性更具准确性和先进性.
文献关键词：
馨香玉兰;特异性单核苷酸多态性;遗传多样性;简化基因组测序技术
中图分类号：
作者姓名：
张涛;李学;张竞;印轩鹏;贺水莲
作者机构：
云南农业大学园林园艺学院,云南 昆明650201
文献出处：
引用格式：
[1]张涛;李学;张竞;印轩鹏;贺水莲-.极小种群馨香玉兰特异性单核苷酸多态性位点开发)[J].西部林业科学,2022(04):68-74
A类：
馨香玉兰
B类：
极小种群,兰特,特异性单核苷酸多态性,单核苷酸多态性位点,全基因组,SNP,濒危,野生居群,栽培居群,个个,简化基因组测序技术,SLAF,seq,建库,数据质控,共获,高度一致,遗传多样性分析,杂合度,He,Shannon,Nei,多样性指数,点解
AB值：
0.197585
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