典型文献
应用重测序技术对杜仲叶片变异及皱缩性状基因的筛选
文献摘要：
以观赏型良种'华仲11号'杜仲(Eucommia ulmoides'Huazhong No.11')及其叶片呈皱缩性状的芽变杜仲为研究对象,提取DNA进行10倍的全基因组重测序.对比'华仲11号'杜仲及其芽变杜仲在叶片形态形成、激素合成方面的变异位点,分析相关变异位点的生物学意义,筛选叶片皱缩形状相关的基因,探索与杜仲(Eucommia ul-moides)叶片皱缩性状紧密联系的单核苷酸多态性(SNP)位点,筛选杜仲叶片性状相关变异基因.结果表明:'华仲11号'杜仲及其芽变杜仲,与参考基因组之间均发生单核苷酸多态性、小片段的插入和缺失(InDel)、染色体结构变异(SV).在杜仲参考基因组(1.18×109)基础上,芽变杜仲具有5732071个单核苷酸多态性、293566个小片段的插入和缺失、3722个染色体结构变异;'华仲11号'具有5711141个单核苷酸多态性、293078个小片段的插入和缺失、3870个染色体结构变异.通过'华仲11号'杜仲及其芽变杜仲之间的比较发现,含有变异位点的26722条基因与蛋白功能变异有关;根据数据库功能注释结果,共筛选出13条有关基因及30个单核苷酸多态性位点.
文献关键词：
杜仲;芽变杜仲;叶片性状变异;叶片变异基因
中图分类号：
作者姓名：
陈梦娇;李慧;王珊珊;杜红岩;王璐;朱景乐
作者机构：
河南农业大学,郑州,450002;东北林业大学;中国林业科学研究院经济林研究所
文献出处：
引用格式：
[1]陈梦娇;李慧;王珊珊;杜红岩;王璐;朱景乐-.应用重测序技术对杜仲叶片变异及皱缩性状基因的筛选)[J].东北林业大学学报,2022(06):7-14
A类：
芽变杜仲,moides,叶片变异基因
B类：
杜仲叶片,皱缩,观赏型,良种,Eucommia,ulmoides,Huazhong,No,全基因组重测序,叶片形态,变异位点,生物学意义,SNP,参考基因,小片,InDel,染色体结构变异,SV,有变,蛋白功能,功能注释,单核苷酸多态性位点,叶片性状变异
AB值：
0.177988
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