典型文献
基于SLAF-seq的天竺桂群体遗传变异分析
文献摘要：
[目的]探讨我国天竺桂资源的遗传多样性及群体的空间分布格局.[方法]分别对来自7个天然群体的30份天竺桂资源进行特异位点扩增片段测序(specific-locus amplified fragment sequencing,SLAF-seq).基于检测到的SNP位点信息进行遗传变异分析.[结果]各样品的平均测序深度为15.11倍,开发获得1 296 000个SLAF标签,其中377 250个SLAF标签在不同样品间具有多态性,共包含3 409 402个群体SNP,经过滤,最终获得268 821个高度一致性的群体SNP.基于这些SNP的系统进化分析发现,天竺桂是由中国东部向中国西部逐渐进化的.系统进化、主成分分析和群体结构分析均表明,来自5省(直辖市)7个天然群体的群体内变异小于群体间变异.30份天竺桂资源可分为2个大的亚群,其中,第1亚群位于中国第2阶梯上,第2亚群位于中国第3阶梯上,2个亚群间被大兴安岭—太行山脉—巫山—雪峰山山脉阻隔.第2亚群又可进一步分为3个小亚群,其中,来自浙江省和安徽桃岭的为第1个小亚群,来自安徽霍山的为第2个小亚群,而来自河南伏牛山的为第3个小亚群,第1个和第2个小亚群间被长江阻隔.[结论]山脉和湖泊的阻隔可能是造成天竺桂遗传分化的重要因素.本研究首次揭示天竺桂遗传结构及地理变化规律,为我国天竺桂资源的有效利用与科学保护提供理论依据.
文献关键词：
天竺桂;SLAF-seq;SNP;遗传分析
中图分类号：
作者姓名：
杨颖;刘向东;段豪;芦治国
作者机构：
江苏省中国科学院植物研究所,江苏省落羽杉属树木种质创新与繁育工程研究中心,江苏 南京 210014
文献出处：
引用格式：
[1]杨颖;刘向东;段豪;芦治国-.基于SLAF-seq的天竺桂群体遗传变异分析)[J].南京林业大学学报（自然科学版）,2022(05):33-39
A类：
B类：
SLAF,天竺桂,群体遗传,遗传变异分析,遗传多样性,空间分布格局,天然群体,异位,specific,locus,amplified,fragment,sequencing,SNP,位点信息,签在,多态性,高度一致,系统进化分析,中国东部,中国西部,群体结构分析,直辖市,群体内,群体间,亚群,大兴安岭,太行山脉,巫山,雪峰山,山山脉,阻隔,安徽霍山,伏牛山,湖泊,成天,遗传分化,遗传结构,科学保护,遗传分析
AB值：
0.314486
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