典型文献
基于SSR标记的麻栎天然群体遗传多样性分析
文献摘要:
[目的]基于SSR分子标记对麻栎天然群体遗传多样性与遗传结构进行分析,为麻栎种质资源的保护和利用提供理论基础.[方法]以分布于我国7个省8个麻栎天然群体的150个个体为研究对象,利用筛选出的18对SSR引物,使用GenAIEx 6.51、MEGA 7.0.26和Structure 2.3.4等软件,采用AMOVA分析、主成分分析、聚类分析和Structure分析等方法,对麻栎群体及相应个体的遗传多样性、分子方差、遗传距离及遗传结构进行研究.[结果]18个SSR位点的等位基因数(Na)平均为5.625个,有效等位基因数(Ne)平均为4.104个,Shannon指数(I)平均为1.338,观测杂合度(Ho)平均为0.895,期望杂合度(He)平均为0.645,筛选出的18对麻栎SSR引物具有丰富的多态性.8个麻栎群体的遗传距离为0.222~1.587,遗传一致度为0.205~0.801,遗传分化系数(Fst)平均为0.252,基因流(Nm)平均为1.140,固定指数(F)均为负值且平均为-0.441.麻栎群体的遗传多样性水平较高,遗传分化小,且群体间存在杂合子剩余;其98%的变异来自群体内,2%的变异来自群体间.UPGMA聚类分析、Structure分析均将8个群体分为2组,二者的个体组成成分存在一定差异;主成分分析结果与上述基本一致,存在一定的交叉引种及基因渐渗现象.[结论]麻栎群体遗传多样性水平较高,遗传分化水平较低,遗传差异主要存在于群体内部,并呈现出沿"西南—东北"方向地理变异规律.因此,对麻栎天然群体的保护应该采取原地保护和异地繁育保存相结合的措施.
文献关键词:
麻栎;天然群体;SSR分子标记;遗传多样性;遗传结构
中图分类号:
作者姓名:
吕锋;解孝满;韩彪;鲁仪增;王磊;董昕;王艳;陆璐;刘莉;宗绍宁;李文清
作者机构:
山东师范大学生命科学学院,山东 济南 250014;山东省林草种质资源中心,山东 济南 250102
文献出处:
引用格式:
[1]吕锋;解孝满;韩彪;鲁仪增;王磊;董昕;王艳;陆璐;刘莉;宗绍宁;李文清-.基于SSR标记的麻栎天然群体遗传多样性分析)[J].南京林业大学学报(自然科学版),2022(03):109-116
A类:
GenAIEx
B类:
SSR,麻栎,天然群体,群体遗传,遗传多样性分析,分子标记,遗传结构,种质资源,保护和利用,个个,引物,MEGA,Structure,AMOVA,子方,遗传距离,等位基因,Na,Ne,Shannon,杂合度,Ho,He,多态性,遗传分化,Fst,基因流,Nm,负值,群体间,杂合子,群体内,UPGMA,体组成,组成成分,引种,基因渐渗,遗传差异,地理变异,变异规律,原地保护,异地,繁育
AB值:
0.346548
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