典型文献
基于转录组数据开发福建柏EST-SSR标记
文献摘要：
福建柏是一种优良的材用树种,主要分布于中国东南部至西南部以及越南北部.开发表达序列标签-简单序列重复(Expression sequence tags-simple sequence repeat,EST-SSR)分子标记有利于完善福建柏育种策略.采用转录组测序技术(RNA-seq)进行测序及基于转录组组装的SSR的开发,初步获得109个引物和12个EST-SSR多态性标记.从3个种群的57个福建柏个体中鉴定的等位基因数目为2～8个.观测杂合度(Ho)和期望杂合度(He)的范围分别在0～1和0.051～0.775之间,均值分别为0.277和0.420等位基因多态性信息含量的范围在0.139～0.784之间,平均为0.482.实验结果提供了一套可用于监测福建柏种群动态以及发展育种和遗传保护措施的微卫星标记.
文献关键词：
福建柏;EST-SSR分子标记;遗传多样性
中图分类号：
作者姓名：
苏顺德
作者机构：
福建省林业科学研究院、国家林业和草原局南方山地用材林培育重点实验室、福建省森林培育与林产品加工利用重点实验室,福建福州350012
文献出处：
引用格式：
[1]苏顺德-.基于转录组数据开发福建柏EST-SSR标记)[J].福建林业科技,2022(02):1-6
A类：
B类：
转录组数据,数据开发,发福,福建柏,EST,SSR,树种,中国东南部,西南部,越南,南北部,简单序列重复,Expression,sequence,tags,simple,repeat,分子标记,育种策略,转录组测序技术,组组,引物,等位基因,杂合度,Ho,He,基因多态性,多态性信息含量,种群动态,保护措施,微卫星标记,遗传多样性
AB值：
0.38526
相似文献
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
