典型文献
不同种源蒙古栎遗传变异
文献摘要：
分析蒙古栎EST序列和叶绿体全基因组SSR位点信息,开发SSR引物,对蒙古栎群体遗传变异进行分析,为蒙古栎分子标记辅助育种奠定基础.利用est-trimmer、CAP3对蒙古栎EST序列处理,通过perl结合MI-SA、Primer3和Electronic PCR查找SSR位点,设计引物并筛选验证.EST序列中发现SSR位点163个,主要重复类型为二核苷酸.叶绿体基因组上88个SSR位点以单核苷酸重复为主.7对引物共检测到37对等位基因,平均等位基因数(Na)=5.286,Shannon's信息指数(I)=1.291,期望杂合度(He)=0.622,多态性信息含量(PIC)=0.692;群体间遗传分化系数(Fst)=0.147,基因流(Nm)=1.933;AMOVA分析表明,种源间遗传变异占10.216％.蒙古栎种源群体间存在中等水平的遗传分化,其遗传变异主要来源于种源内,且种源间的遗传变异与地理距离无显著相关性.基于EST序列及叶绿体基因组SSR位点信息,有效开发SSR引物,为蒙古栎遗传多样性研究提供更多的标记支持.
文献关键词：
蒙古栎;EST-SSR;遗传多样性
中图分类号：
作者姓名：
李波;张伟溪;丁密;余金金;丁昌俊;黄秦军
作者机构：
国家林业和草原局林木培育重点实验室(中国林业科学研究院林业研究所) ,北京,100091
文献出处：
引用格式：
[1]李波;张伟溪;丁密;余金金;丁昌俊;黄秦军-.不同种源蒙古栎遗传变异)[J].东北林业大学学报,2022(04):8-14,26
A类：
trimmer
B类：
不同种源,蒙古栎,遗传变异,EST,叶绿体全基因组,SSR,位点信息,引物,群体遗传,分子标记辅助育种,est,CAP3,列处理,perl,MI,SA,Primer3,Electronic,重复类型,叶绿体基因组,单核苷酸,等位基因,Na,Shannon,杂合度,He,多态性信息含量,PIC,群体间,遗传分化,Fst,基因流,Nm,AMOVA,中等水平,地理距离,显著相关性,有效开发,遗传多样性,多样性研究
AB值：
0.343964
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