典型文献
岷江柏野生居群和迁地保护居群的遗传多样性比较
文献摘要：
通过分析岷江柏的迁地保护居群和野生居群的遗传多样性、遗传结构及居群间基因流,判断迁地保护岷江柏居群的遗传多样性水平,为其迁地保护提供理论基础.本研究利用GBS(Genotyping-by-Sequencing)测序技术获得的SNP位点对四川大渡河双江口岷江柏迁地保护移栽苗、苗圃播种苗及3个野生居群进行主成分分析(PCA分析)、聚类分析、分子进化树、遗传多样性和遗传结构分析.经过GBS测序共获得高质量Clean Data 118321514728 bp,并开发了1947047个tags,从中鉴定到了1259610个SNP位点.系统发育进化树显示大部分移栽岷江柏居群和野生岷江柏聚在一起,居群结构分析结果显示交叉验证错误率的谷值确定最优分群数为1.4个岷江柏居群的观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、Shannon信息指数I(Shi)、近交系数(Fis)、多态信息含量(Pic)的值分别为0.1815～0.2720、0.2232～0.3003、0.3310～0.4649、0.1780～0.2465和0.2722～0.3092,说明岷江柏居群的遗传多样性水平较高.移栽岷江柏居群的He=0.3003,Shi=0.4649,岷江柏居群迁地保护居群遗传多样性总体水平略高于野生居群.野生岷江柏居群中白湾隧道(BW)_vs_松岗镇(SA)的遗传分化指数(Fst)较大,基因流(Nm)较小(Fst=0.091,Nm=2.496),而迁地保护的岷江柏居群与野生岷江柏居群没有明显的遗传分化,居群间的基因交流频繁(Fst<0.05,基因流Nm>4),说明没有明显的分群现象,岷江柏居群迁地保护居群遗传多样性较高.因此,移栽濒危植物是迁地保护过程中较好的方法,本文为以后野生岷江柏迁地保护提供参考,为其他树木种质资源的保存提供理论依据.
文献关键词：
岷江柏;野生居群;迁地保护居群;GBS;遗传多样性;遗传结构
中图分类号：
作者姓名：
常二梅;刘建锋;黄跃宁;李红丽;单冰燕;江泽平;赵秀莲
作者机构：
中国林业科学研究院林业研究所,北京 100091;国家林业局林木培育重点实验室,北京 100091;北京林业大学,北京100083;邯郸市永年区农业农村局,河北 056011;中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所,北京 100091
文献出处：
引用格式：
[1]常二梅;刘建锋;黄跃宁;李红丽;单冰燕;江泽平;赵秀莲-.岷江柏野生居群和迁地保护居群的遗传多样性比较)[J].植物研究,2022(05):772-779
A类：
迁地保护居群,松岗镇
B类：
岷江柏,野生居群,基因流,研究利用,GBS,Genotyping,by,Sequencing,技术获得,SNP,大渡河,双江口,移栽苗,苗圃,播种苗,分子进化树,遗传多样性和遗传结构,遗传结构分析,共获,Clean,Data,bp,tags,系统发育进化树,聚在一起,居群结构,交叉验证,错误率,谷值,分群,杂合度,Ho,He,Shannon,Shi,近交系数,Fis,多态信息含量,Pic,总体水平,略高于,BW,SA,遗传分化,Fst,Nm,基因交流,濒危植物,树木,种质资源
AB值：
0.238307
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