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感染寨卡病毒后埃及伊蚊黄病毒NIRVS表达的检测
文献摘要:
本研究通过高通量测序技术检测了寨卡病毒(ZIKV)感染组、血餐对照组和糖水对照组埃及伊蚊中肠组织小RNA的丰度,并筛选出差异表达的6个黄病毒NIRVS和9个棒状病毒NIRVS.针对筛选出的6个NIRVS设计引物用两步法逆转录荧光定量PCR(RT-qPCR)方法验证了ZIKV感染第4、7和10天中肠组织中黄病毒NIRVS片段的表达.结果显示,黄病毒NIRVS AeFlavi53在感染第4、7天均上调,结果与小RNA测序一致,AeFlavi34B和AeFlavi4A在感染第4天上调,第10天下调,但在第7天表达无变化,与小RNA测序结果不一致,其余片段表达量在感染组与对照组间无统计学差异.RT-qPCR与高通量测序的结果一致性差,其原因可能是因为细胞中长链piRNA前体受上游转录和下游酶切多个程序的调节,针对其设计引物进行定量检测的结果不稳定.
文献关键词:
小RNA测序;RT-qPCR;黄病毒NIRVS;埃及伊蚊;寨卡病毒
中图分类号:
作者姓名:
刘源;姜玉庭;贾楠;张恒端;李春晓;邢丹;郭晓霞;高剑;赵彤言
作者机构:
军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所,病原微生物生物安全国家重点实验室,媒介生物危害和自然疫源性疾病北京市重点实验室,北京100071
文献出处:
引用格式:
[1]刘源;姜玉庭;贾楠;张恒端;李春晓;邢丹;郭晓霞;高剑;赵彤言-.感染寨卡病毒后埃及伊蚊黄病毒NIRVS表达的检测)[J].寄生虫与医学昆虫学报,2022(01):33-39
A类:
NIRVS,AeFlavi53,AeFlavi34B,AeFlavi4A
B类:
寨卡病毒,埃及伊蚊,黄病毒,高通量测序技术,ZIKV,糖水,中肠,出差,差异表达,棒状,引物,两步法,逆转录,qPCR,方法验证,中黄,天上,结果不一致,统计学差异,结果一致性,长链,piRNA,游转,定量检测
AB值:
0.228868
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