典型文献
埃及伊蚊6个丝氨酸蛋白酶(CLIPs)基因生物信息学分析及功能的初步研究
文献摘要：
目的 对埃及伊蚊6个丝氨酸蛋白酶(CLIPs)基因进行系统分析,为埃及伊蚊先天免疫功能的研究提供理论基础.方法 利用生物信息学研究方法,使用在线软件Clustal Omega分析CLIPs在物种间的相似性,利用在线工具SOPMA对其二级结构进行预测,利用MEGA 7.0软件构建系统进化树;通过实时荧光定量PCR(RT-qPCR)方法研究6个CLIPs基因在埃及伊蚊从卵到成虫的发育时期及未吸血雌蚊不同组织中的表达情况;通过细菌侵染雌性成蚊,研究6个CLIPs对不同细菌感染时的诱导动力学.采用单因素方差分析对实验结果进行比较.结果 从美国国立生物技术信息中心的GeneBank数据库中得到埃及伊蚊6个CLIPs基因,通过生物信息学分析,发现其氨基酸序列在羧基端蛋白酶结构域同源性较高,在蛋白的二级结构中,无规卷曲所占比重最高,占53.82％～62.50％.系统发育分析表明,埃及伊蚊6个CLIPs基因存在2个不同的分支,其中1个分支与冈比亚按蚊2个CLIPs基因有较高的同源性,另1个分支与黑腹果蝇SP5有较高的同源性.时空表达谱结果显示,埃及伊蚊6个CLIPs基因在4龄期幼虫和成蚊中表达水平较为丰富,在蛹期表达水平均较低;在雌性成蚊不同组织中表达水平不同,胸部和脂肪体中均有较高的表达水平,而在马氏管、中肠和卵巢中的表达水平均较低.在细菌感染方面,埃及伊蚊6个CLIPs有着不同的诱导动力学,存在应对微生物侵染时的特异性反应.结论 在埃及伊蚊6个CLIPs蛋白序列中,无规卷曲所占比重最高,在进化关系上,与其他昆虫的CLIPs有较高的同源性.时空表达谱显示,6个CLIPs在伊蚊发育过程和成蚊各个组织中有着不同的表达模式,在应对不同细菌侵染时有着不同的诱导动力学.
文献关键词：
丝氨酸蛋白酶;埃及伊蚊;生物信息学分析;先天免疫
中图分类号：
作者姓名：
王秋慧;王浩城;韩谦;廖承红
作者机构：
海南大学全健康研究院,海南海口 570228
文献出处：
引用格式：
[1]王秋慧;王浩城;韩谦;廖承红-.埃及伊蚊6个丝氨酸蛋白酶(CLIPs)基因生物信息学分析及功能的初步研究)[J].中国媒介生物学及控制杂志,2022(02):183-190
A类：
CLIPs,SP5
B类：
埃及伊蚊,丝氨酸蛋白酶,生物信息学分析,先天免疫,利用生物,生物信息学研究,Clustal,Omega,种间,SOPMA,二级结构,MEGA,软件构建,建系,系统进化树,qPCR,成虫,发育时期,吸血,不同组织,过细,细菌侵染,雌性,成蚊,细菌感染,单因素方差分析,立生,生物技术,信息中心,GeneBank,氨基酸序列,羧基端,酶结构,结构域,同源性,无规,卷曲,系统发育分析,冈比亚,按蚊,黑腹果蝇,时空表达谱,龄期,幼虫,蛹期,组织中表达,胸部,脂肪体,马氏管,中肠,巢中,进化关系,系上,昆虫,表达模式
AB值：
0.271539
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