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基于网络药理学和分子对接的异喹啉生物碱肝毒性机制初探
文献摘要：
目的:通过网络药理学和分子对接技术探讨异喹啉生物碱(IAs)肝毒性(HT)的可能作用机制.方法:通过互联网科学数据库the web of science,PubMed,ScienceDirect,Geenmedical收集IAs的候选毒性化合物和靶点;从Genecards Database中获得HT相关靶点,并利用STRING数据库对IAs肝毒性的靶点基因进行分析;Cytoscape软件构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,CytoHubba插件筛选核心基因;通过Bioinformatics网站对IAs肝毒性的靶点基因进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析.最后,使用Auto dock软件对核心毒性化合物和核心基因进行分子对接验证,并用pymol软件就对接结果进行3D可视化分析.结果:互联网科学数据库显示有13种IAs活性成分存在HT;PPI网络和核心靶点分析表明ANXA5、CASP3、CCL5、IL2和PPARG是HT的关键靶点.GO和KEGG分析显示,IAs可通过癌症途径、癌症中的蛋白多糖以及癌症中的微小RNA等通路参与过氧化氢的反应、凋亡过程的正调控等多种生物学过程.此外,分子对接方法证实了IAs的13种生物活性分子与HT靶点高度亲和,其结合活性可能受到化学结构中五碳环所处的位置,所连的基团,以及是否闭环有影响.结论:通过网络药理学和分子对接,从IAs的活性化合物可能通过作用于5个核心基因以及33条信号通路导致肝毒性.
文献关键词：
异喹啉生物碱;肝毒性;网络药理学;分子对接
中图分类号：
作者姓名：
梁迪;王辉;谌立巍;陈思敏
作者机构：
成都中医药大学药学院,四川成都611137
文献出处：
引用格式：
[1]梁迪;王辉;谌立巍;陈思敏-.基于网络药理学和分子对接的异喹啉生物碱肝毒性机制初探)[J].中药与临床,2022(06):44-50,69
A类：
B类：
网络药理学,异喹啉生物碱,肝毒性,毒性机制,机制初探,分子对接技术,技术探讨,IAs,HT,科学数据,web,science,ScienceDirect,Geenmedical,Genecards,Database,STRING,靶点基因,Cytoscape,软件构建,蛋白质相互作用,PPI,CytoHubba,插件,核心基因,Bioinformatics,基因本体,京都基因与基因组百科全书,富集分析,Auto,dock,心毒性,pymol,活性成分,核心靶点,ANXA5,CASP3,CCL5,IL2,PPARG,关键靶点,正调控,生物学过程,对接方法,生物活性分子,结合活性,化学结构,基团,活性化合物
AB值：
0.346922
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