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典型文献
基于网络药理学与GEO生信统计的瘀血痹抗类风湿性关节炎的活性成分及作用机制研究
文献摘要:
目的:基于网络药理学与基因表达综合(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库挖掘初步揭示瘀血痹胶囊发挥抗类风湿性关节炎(RA)的潜在活性成分及作用机制.方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、GeneCards数据库筛选出瘀血痹胶囊活性化学成分、作用靶点及RA靶点,采用STRING 11.0数据库对其交集靶点进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络构建,采用Bioconductor数据库进行基因本体(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析;通过GEO数据库下载基因芯片数据(GSE55457),经过基因探针富集分析(GSEA)筛选出差异表达基因,联用分子对接对差异基因与排名靠前的活性化合物进行虚拟验证.结果:筛选出瘀血痹胶囊128个有效成分和85个与RA的交集靶点,其中度值排名靠前的化合物有槲皮素、木犀草素和山柰酚等.GO功能富集结果显示,RA靶点参与生物过程、分子功能、细胞组分的多种调控过程.KEGG通路富集结果显示,炎性因子和受体信号通路可能为瘀血痹胶囊对RA发挥作用的主要通路.差异表达基因与交集靶点交集有白细胞介素-6(IL-6)、DNA修复酶1(PARP1)、核转录因子-κB激酶亚基β抑制剂(IKBKB)、雄激素受体(AR)、半胱氨酸蛋白酶-3(CASP3)、表皮生长因子受体(EGFR)、丝裂原活化蛋白激酶8(MAPK8)、多不饱和脂肪酸5-脂氧合酶(ALOX5)等.分子对接结果显示,β-谷甾醇、鞣花酸、7-O-甲基异鼠李糖醇、木犀草素、槲皮素、异鼠李素、山柰酚、β-胡萝卜素等与差异性基因对接活性较好.结论:瘀血痹胶囊中的β-谷甾醇、木犀草素、槲皮素等核心化合物可能是通过作用于IL-6、PARP1、IKBKB、AR、CASP3等靶点对RA起治疗作用,为瘀血痹胶囊后续深入研究及临床应用提供了数据支持.
文献关键词:
类风湿性关节炎;瘀血痹胶囊;网络药理学;基因表达综合数据库;分子对接;作用机制
作者姓名:
孙彩虹;杨志城;房庆伟;吴若铭;李坤;叶冠
作者机构:
上海医药集团股份有限公司 中央研究院,上海 201203
文献出处:
引用格式:
[1]孙彩虹;杨志城;房庆伟;吴若铭;李坤;叶冠-.基于网络药理学与GEO生信统计的瘀血痹抗类风湿性关节炎的活性成分及作用机制研究)[J].中国现代中药,2022(04):676-686
A类:
B类:
网络药理学,GEO,生信,抗类风湿,类风湿性关节炎,活性成分,Expression,Omnibus,瘀血痹胶囊,RA,系统药理学,分析平台,TCMSP,GeneCards,作用靶点,STRING,交集靶点,蛋白质相互作用,PPI,网络构建,Bioconductor,基因本体,京都基因与基因组百科全书,富集分析,下载,基因芯片,GSE55457,基因探针,GSEA,出差,差异表达基因,分子对接,差异基因,活性化合物,虚拟验证,有效成分,槲皮素,木犀草素,山柰酚,功能富集,集结,点参,生物过程,通路富集,炎性因子,点交,PARP1,核转录因子,亚基,IKBKB,雄激素受体,半胱氨酸蛋白酶,CASP3,表皮生长因子受体,EGFR,丝裂原活化蛋白激酶,MAPK8,多不饱和脂肪酸,脂氧合酶,ALOX5,谷甾醇,鞣花酸,鼠李糖,糖醇,异鼠李素,胡萝卜素,接活,囊中,治疗作用,基因表达综合数据库
AB值:
0.292813
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