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典型文献
基于网络药理学和分子对接技术探究槲皮素治疗非小细胞肺癌的作用机制
文献摘要:
目的:基于网络药理学和分子对接技术探究槲皮素治疗非小细胞肺癌(NSCLC)的作用机制.方法:从GEO数据库选取基因芯片(GSE19188)获得NSCLC相关靶点,并与槲皮素作用靶点映射,使用Cytoscape软件构建"槲皮素-靶点-NSCLC"网络.采用STRING数据库和Cytoscape构建靶标蛋白互作网络并进行拓扑分析,运用ClusterProfiler包进行GO和KEGG富集分析.最后利用AutoDock Vina进行分子对接验证.结果:本研究共预测得到33个槲皮素治疗NSCLC的潜在靶点,利用Cytoscape中MCODE插件构建"槲皮素-靶点-NSCLC"网络和关键模块,筛选得到15个关键基因和3个功能模块.GO和KEGG分析表明核心靶点参与凋亡过程的负调控、蛋白水解等15条生物学过程,作用于癌症信号通路、TNF、PPAR、IL-17和细胞色素P450等15个信号通路.分子对接显示槲皮素与PPI中的核心靶点具有良好对接活性.生存分析显示核心基因与NSCLC患者的五年总生存率具有显著相关性.结论:本研究初步揭示了槲皮素抗NSCLC多靶点、多通路的作用机制,为槲皮素抗NSCLC研究及临床应用提供了理论依据.
文献关键词:
网络药理学;分子对接;槲皮素;非小细胞肺癌;作用机制
作者姓名:
韩坤余;熊常州;夏雪;高朗;王怡丁;蔡政;吴继萍;牛华涛
作者机构:
云南中医药大学第一附属医院,云南 昆明 650021;成都中医药大学,四川 成都 610075;云南省中医医院,云南 昆明 650021;云南省肿瘤医院,云南 昆明 650118
文献出处:
引用格式:
[1]韩坤余;熊常州;夏雪;高朗;王怡丁;蔡政;吴继萍;牛华涛-.基于网络药理学和分子对接技术探究槲皮素治疗非小细胞肺癌的作用机制)[J].中医药信息,2022(06):41-47
A类:
GSE19188
B类:
网络药理学,分子对接技术,技术探究,槲皮素,非小细胞肺癌,NSCLC,GEO,基因芯片,作用靶点,Cytoscape,软件构建,STRING,靶标蛋白,蛋白互作网络,拓扑分析,ClusterProfiler,富集分析,AutoDock,Vina,潜在靶点,MCODE,插件,选得,关键基因,功能模块,核心靶点,点参,负调控,蛋白水解,生物学过程,PPAR,细胞色素,P450,PPI,接活,生存分析,核心基因,总生存率,显著相关性,多靶点,多通路
AB值:
0.317063
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