典型文献
苓桂术甘汤靶向慢性心力衰竭中内质网应激的生物信息学分析
文献摘要:
目的:采用生物信息学分析方法,预测苓桂术甘汤靶向慢性心力衰竭中内质网应激通路的干预机制.方法:通过TCMSP筛选苓桂术甘汤活性成分及靶标,由OMIM、Genecard获取疾病相关靶标,取两者交集得到作用靶点,通过STRING获取蛋白互作网络并借助cytoscape 3.8.0得到富集的前20个靶标,从GEO数据库下载GSE126062获取心衰基因芯片,将上述靶标与内质网应激相关基因带入芯片获取表达谱并绘制相关性热图,cytoscape 3.8.0构建中药-化合物-靶标-内质网应激相关基因的网络图,Autodock用于分子对接.结果:获得苓桂术甘汤治疗慢性心衰相关活性成分105个,作用靶标193个,网络分析提示VEGFA、AKT1﹑ JUN﹑ MAPK3﹑ MMP9﹑ IL6等为关键靶标,基因芯片提示这些靶标与UPR信号传感器通路分子存在部分相关性,分子对接提示苓桂术甘汤相关药物成分不仅能结合关键靶标,对部分内质网应激传感器也存在作用.结论:苓桂术甘汤能通过相关靶标作用于内质网应激通路治疗心衰,其中柚皮素能直接作用于未磷酸化的IRF1a,槲皮素直接靶向ATF4.
文献关键词:
心力衰竭;内质网应激;UPR信号通路;钙调节紊乱;苓桂术甘汤;玄府
中图分类号:
作者姓名:
任强;王丹鹏;曾蕾;龙静;樊明媛;席小荣;陈娇;李雪萍
作者机构:
成都中医药大学附属医院,四川成都610075
文献出处:
引用格式:
[1]任强;王丹鹏;曾蕾;龙静;樊明媛;席小荣;陈娇;李雪萍-.苓桂术甘汤靶向慢性心力衰竭中内质网应激的生物信息学分析)[J].中药与临床,2022(05):82-87
A类:
GSE126062,IRF1a,钙调节紊乱
B类:
苓桂术甘汤,慢性心力衰竭,生物信息学分析,内质网应激通路,干预机制,TCMSP,活性成分,OMIM,Genecard,疾病相关,交集,作用靶点,STRING,蛋白互作网络,cytoscape,GEO,下载,取心,基因芯片,带入,表达谱,热图,网络图,Autodock,分子对接,慢性心衰,VEGFA,AKT1,JUN,MAPK3,MMP9,IL6,关键靶标,UPR,信号传感器,药物成分,分内,柚皮素,直接作用,磷酸化,槲皮素,ATF4,玄府
AB值:
0.321008
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