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典型文献
基于网络药理学和分子对接的熟地黄治疗骨关节炎的作用机制研究
文献摘要:
基于网络药理学、分子对接和体外实验探讨熟地黄治疗骨关节炎的作用机制.研究首先采用核因子κB受体活化因子配体(receptor activator of nucleus factor-κB ligand,RANKL)及巨噬细胞集落刺激因子(macrophage colony-stimulating factor,M-CSF)诱导RAW264.7细胞构建破骨细胞模型评价熟地黄对破骨细胞模型抗酒石酸酸性磷酸酶(TRAP)活性的影响,对熟地黄治疗骨关节炎的药效进行验证.之后通过TCMSP数据库及文献检索,获得熟地黄活性成分,通过SwissTargetPrediction数据库获得活性成分潜在作用靶点,通过OMIM、TTD、GeneCards及DisGeNET数据库收集骨关节炎疾病靶点.利用Venny平台获得熟地黄与骨关节炎交集靶点,使用Cytoscape 3.8.2构建交集靶点蛋白互作网络,基于拓扑算法获得关键靶标.使用DA-VID 数据库对交集靶点进行GO(Gene Ontology)功能分析和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)通路富集分析.RT-qPCR法检测熟地黄对破骨细胞中关键靶点基因表达的影响.最后通过分子对接对成分与关键靶点之间的活性进行验证.结果显示,熟地黄可以有效抑制破骨细胞中的TRAP活性,从而抑制破骨细胞的骨吸收,对骨关节炎起治疗作用.网络药理学结果表明,熟地黄共有14个活性成分,作用靶点与骨关节炎交集靶点126个.网络药理学富集结果筛选到生物过程432条,信号通路139条.靶点网络拓扑分析依据degree得到关键靶点原癌基因酪氨酸蛋白激酶(proto-oncogene tyrosine-protein kinase Src,SRC)、信号转导和转录活化因子 3(signal transducer and activator of transcription 3,STAT3)、转录因子 p65(transcrip-tion factor p65,RELA)等.SRC在破骨细胞中呈现高表达,能够加速骨关节炎的发生.因此选择SRC进行后续实验验证.结果显示,熟地黄能够降低破骨细胞中SRC的基因表达水平.分子对接结果显示毛蕊花糖苷、异类叶升麻苷、棉子糖与SRC有较好的结合活性,可能为熟地黄治疗骨关节炎的关键成分.综上,熟地黄可以通过作用于SRC,抑制破骨细胞的骨吸收,平衡关节软骨及软骨下骨的骨代谢,从而对骨关节炎起治疗作用.此外,熟地黄可能通过STAT3、RELA等靶点,通过PI3K-AKT信号通路、IL-17信号通路等相关通路,对骨关节炎发挥整体疗效.
文献关键词:
骨关节炎;熟地黄;网络药理学;分子对接
作者姓名:
凤雯晴;刘凯洋;张嘉宁;李勇枝;刘军莲;卢建秋;张燕玲
作者机构:
北京中医药大学中药学院国家中医药管理局中药信息工程重点实验室,北京102488;中国航天员科研训练中心,北京100094
文献出处:
引用格式:
[1]凤雯晴;刘凯洋;张嘉宁;李勇枝;刘军莲;卢建秋;张燕玲-.基于网络药理学和分子对接的熟地黄治疗骨关节炎的作用机制研究)[J].中国中药杂志,2022(19):5336-5343
A类:
B类:
网络药理学,分子对接,熟地黄,骨关节炎,体外实验,核因子,活化因子,receptor,activator,nucleus,ligand,RANKL,巨噬细胞集落刺激因子,macrophage,colony,stimulating,CSF,RAW264,破骨细胞,细胞模型,模型评价,抗酒石酸酸性磷酸酶,TRAP,药效,TCMSP,文献检索,活性成分,SwissTargetPrediction,潜在作用,作用靶点,OMIM,TTD,GeneCards,DisGeNET,Venny,交集靶点,Cytoscape,建交,靶点蛋白,蛋白互作网络,关键靶标,DA,VID,Ontology,功能分析,Kyoto,Encyclopedia,Genes,Genomes,通路富集分析,qPCR,关键靶点,靶点基因,骨吸收,治疗作用,集结,生物过程,靶点网络,网络拓扑分析,degree,原癌基因,酪氨酸蛋白激酶,proto,oncogene,tyrosine,protein,kinase,Src,SRC,信号转导,signal,transducer,transcription,STAT3,p65,RELA,基因表达水平,毛蕊花糖苷,异类,类叶升麻苷,棉子糖,结合活性,关键成分,关节软骨,软骨下骨,骨代谢,PI3K,AKT,相关通路
AB值:
0.298467
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