典型文献
基于生物信息学分析RNF111基因在肾透明细胞癌中的表达及临床意义
文献摘要：
目的 通过在线数据库挖掘分析RNF111基因在肾透明细胞癌(KIRC)患者组织中的表达、临床意义和生物学功能.方法 应用GEPIA、TIMER、UALCAN、HPA、LinkedOmics和DAVID等在线生物信息学工具分析TCGA数据库中RNF111基因在KIRC组织和癌旁组织中表达水平及与患者预后的关系,并对相关蛋白功能和KEGG信号通路进行富集;应用GeneMANIA数据库构建RNF111蛋白-蛋白相互作用网络.结果 RNF111在KIRC组织中表达水平显著低于正常肾组织;RNF111在KIRC患者不同病理分期和分级中存在表达差异,且随着病理分期和分级的升高,其表达水平有下调趋势.生存分析表明,RNF111的表达水平与KIRC患者的总体生存率与无病生存率显著相关,RNF111高表达组患者总体生存率和无病生存率明显高于RNF111低表达组患者.GO生物学富集分析结果 表明,RNF111与RNA聚合酶Ⅱ启动子的转录延伸、蛋白酶体介导的泛素依赖性蛋白质分解代谢过程及蛋白质多聚泛素化等生物过程有关.KEGG分析结果 显示,RNF111表达相关基因与胞吞作用、肾细胞癌及泛素介导的蛋白水解等信号通路相关.结论 在KIRC中RNF111的表达与患者的病理分期及预后有相关性,因此RNF111可能成为KIRC的预后标志物及潜在治疗靶点.
文献关键词：
癌症基因图谱数据库;RNF111基因;癌;肾细胞;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
林乐成;陈伶俐;陈志鸿
作者机构：
右江民族医学院,广西 百色 530000
文献出处：
引用格式：
[1]林乐成;陈伶俐;陈志鸿-.基于生物信息学分析RNF111基因在肾透明细胞癌中的表达及临床意义)[J].右江民族医学院学报,2022(06):819-824,834
A类：
B类：
生物信息学分析,RNF111,肾透明细胞癌,挖掘分析,KIRC,患者组织,生物学功能,GEPIA,TIMER,UALCAN,HPA,LinkedOmics,DAVID,生物信息学工具,TCGA,癌旁组织,组织中表达,蛋白功能,GeneMANIA,数据库构建,蛋白相互作用网络,低于正常,肾组织,病理分期,表达差异,生存分析,总体生存率,无病生存率,低表达,富集分析,启动子,转录延伸,蛋白酶体,分解代谢,代谢过程,多聚泛素,泛素化,生物过程,胞吞作用,肾细胞癌,蛋白水解,预后标志物,潜在治疗,治疗靶点,癌症基因图谱数据库
AB值：
0.285117
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