典型文献
USP39在肝细胞癌中的表达及其与预后、免疫浸润的相关性分析
文献摘要：
目的 探究去泛素化酶USP39在肝细胞癌(Liver hepatocellular carcinoma,LIHC)中的表达及其与预后、免疫浸润的关系,并预测其生物学功能.方法 从癌症基因组图谱(The cancer Genome Atlas,TCGA)数据库和国际癌症基因组协会(The International Cancer Genome Consortium,ICGC)数据库获取原始数据,采用表达差异分析、临床相关性分析、Kaplan-Meier分析、单因素和多因素Cox分析USP39在评估肝细胞癌患者预后中的作用.采用ICGC对USP39在TCGA-LIHC中的表达及生存分析进行验证.应用基因集富集分析(gene-set enrichment analysis,GSEA)软件预测USP39可能参与的分子通路,并分析USP39与潜在靶基因的相关性.通过肿瘤免疫评估资源(Tumor Immune Estimation Resource,TIMER)数据库分析USP39与肝细胞癌免疫浸润的关系.结果 USP39在肝细胞癌组织中显著高表达(均FDR<0.05),USP39表达与肿瘤分期,组织学分级和肿瘤大小均具有相关性(均P<0.001);USP39高表达的肝细胞癌患者生存率低于低表达患者,且USP39可作为肝细胞癌患者的独立预后因子(均P<0.05).GSEA和潜在靶基因相关性分析显示USP39与自噬过程相关,且USP39与ATG4B、ATG16L1、BIRC6、TSC1具有相关性(|r|>0.4,均P<0.001).TIMER数据库分析显示USP39与免疫细胞浸润具有显著相关性.结论 USP39表达与肝细胞癌患者预后及免疫浸润具有相关性,并且其可能通过肿瘤细胞自噬调控肝细胞癌的进展.
文献关键词：
肝细胞癌;USP39;预后;免疫细胞浸润;生物信息学分析
中图分类号：
作者姓名：
李浩令;包智航;仰高伟;倪宇轩;王文锐
作者机构：
蚌埠医学院 癌症转化医学安徽省重点实验室,安徽 蚌埠 233030;蚌埠医学院 生命科学学院,安徽 蚌埠 233030
文献出处：
引用格式：
[1]李浩令;包智航;仰高伟;倪宇轩;王文锐-.USP39在肝细胞癌中的表达及其与预后、免疫浸润的相关性分析)[J].牡丹江医学院学报,2022(01):16-22
A类：
B类：
USP39,肝细胞癌,免疫浸润,去泛素化酶,Liver,hepatocellular,carcinoma,LIHC,生物学功能,癌症基因组图谱,cancer,Genome,Atlas,TCGA,International,Cancer,Consortium,ICGC,原始数据,表达差异,临床相关性,Kaplan,Meier,Cox,生存分析,基因集富集分析,gene,set,enrichment,analysis,GSEA,软件预测,分子通路,靶基因,肿瘤免疫,免疫评估,Tumor,Immune,Estimation,Resource,TIMER,数据库分析,癌组织,FDR,肿瘤分期,组织学分级,肿瘤大小,低表达,预后因子,ATG4B,ATG16L1,BIRC6,TSC1,免疫细胞浸润,显著相关性,肿瘤细胞,细胞自噬,生物信息学分析
AB值：
0.371173
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