典型文献
小豆WRKY基因家族鉴定及应答锈菌侵染的表达分析
文献摘要：
为明确小豆WRKY转录因子在抗锈病中的功能,研究采用生物信息学方法,对小豆基因组中WRKY基因家族进行了分析,结果表明,小豆基因组中共包含90个WRKY转录因子(VaWRKYs),其中82个成员分别定位于小豆的11条染色体上.依据WRKY基因家族高度保守的WRKY七肽域和锌指结构对小豆WRKY家族进行分类,发现VaWRKYs包含GroupⅠ(17个)、GroupⅡ(61个)和GroupⅢ(12个)等3个亚家族,进一步的系统发育分析表明,GroupⅡ亚家族还包括Ⅱ-a(6个)、Ⅱ-b(16个)、Ⅱ-c(21个)、Ⅱ-d(7个)和Ⅱ-e(11个)5个亚组.蛋白序列特征分析发现,VaWRKYs成员在七肽域和锌指结构上存在多个氨基酸位点的变异.利用课题组前期获得的抗病小豆品种接种后24和48 h的转录组数据对VaWRKYs成员的表达进行分析,共检测到82个成员不同水平表达,且多达67个成员的表达水平受锈菌侵染的影响,暗示小豆WRKY基因家族在小豆抗锈病过程中起重要的调控作用.
文献关键词：
WRKY转录因子;小豆;豇豆单胞锈菌;基因表达
中图分类号：
作者姓名：
滑艳敏;杨阳;孙伟娜;殷丽华;柯希望;穆娟微;左豫虎
作者机构：
黑龙江八一农垦大学农学院/黑龙江省作物有害生物互作生物学及生态防控重点实验室,国家杂粮工程技术研究中心,大庆163319;四川省广元市昭化区农业农村局;黑龙江省农垦科学院植物保护研究所
文献出处：
引用格式：
[1]滑艳敏;杨阳;孙伟娜;殷丽华;柯希望;穆娟微;左豫虎-.小豆WRKY基因家族鉴定及应答锈菌侵染的表达分析)[J].黑龙江八一农垦大学学报,2022(06):36-44
A类：
VaWRKYs
B类：
小豆,基因家族鉴定,侵染,表达分析,抗锈,锈病,生物信息学方法,锌指,Group,亚家族,系统发育分析,序列特征分析,氨基酸位点,转录组数据,不同水平,多达,暗示,豇豆单胞锈菌
AB值：
0.197197
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