典型文献
特发性肺纤维化相关的微阵列鉴定基因和microRNA分析
文献摘要：
目的 通过特发性肺纤维化(idiopathic pulmonary fibrosis,IPF)的微小RNA(microRNA,miRNA)-mRNA相互作用网络识别微阵列鉴定基因和miRNA.方法 使用从基因表达综合(gene expression omnibus,GEO)数据库(GSE27430和GSE135065)下载的IPF患者数据选择差异表达的miRNA和mRNA.使用转录因子富集分析选择miRNA,并使用miRDB、miRTarBase和TargetScan过滤miRNA的靶mRNA.使用Cytoscape软件可视化miRNA和mRNA之间的网络并计算Hub基因.使用GO和KEGG途径分析调节网络中的mRNA.结果 共选择21个miRNA和119个mRNA,重建由3个miRNA和3个mRNA组成的miRNA-mRNA网络.hsa-miR-199a-5p、hsa-miR-299-5p、hsa-miR-338-3p、NTNG1、SCN2A、TM6SF1被确定为关键的调节因子.结论 发现了IPF发病机制中涉及的几个重要的Hub基因和miRNA,其中hsa-miR-199a-5p/NTNG1和hsa-miRV299-5 p/SCN2 A途径可能在IPF中起重要作用,可以帮助识别病因,并提供潜在的治疗靶点.
文献关键词：
特发性肺纤维化;基因;微小RNAs
中图分类号：
作者姓名：
宋鹏;张猛;姜淑娟;杨栋梁
作者机构：
山东第一医科大学附属省立医院呼吸与危重症医学科,山东 济南 250000;山东省济南市人民医院全科医学科,山东 济南 271100;沧州医学高等专科学校公共课教学部,河北 沧州 061000
文献出处：
引用格式：
[1]宋鹏;张猛;姜淑娟;杨栋梁-.特发性肺纤维化相关的微阵列鉴定基因和microRNA分析)[J].河北医科大学学报,2022(03):258-264
A类：
GSE27430,GSE135065,NTNG1,TM6SF1,miRV299,SCN2
B类：
特发性肺纤维化,微阵列,microRNA,idiopathic,pulmonary,fibrosis,IPF,miRNA,相互作用网络,gene,expression,omnibus,GEO,下载,患者数据,数据选择,选择差异,差异表达,富集分析,miRDB,miRTarBase,TargetScan,Cytoscape,Hub,途径分析,共选,hsa,199a,5p,3p,SCN2A,调节因子,治疗靶点,RNAs
AB值：
0.324184
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