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典型文献
基于生物信息学分析PTX3基因在乳腺癌中的表达及临床意义
文献摘要:
目的:通过分析生物信息数据库相关资料,探究五聚蛋白3(PTX3)基因在乳腺癌中的表达和临床意义.方法:利用TIMER数据库和GEPIA2.0数据库对PTX3 mRNA在正常乳腺组织和乳腺癌组织中的表达进行分析;利用UALCAN数据库和Kaplan-Meier Plotter数据库分析PTX3与乳腺癌临床特征和预后的关系;利用STRING数据库构建PTX3蛋白相互作用网络;利用CancerSEA数据库分析PTX3基因与乳腺癌单个细胞功能状态的相关性.结果:TIMER和GEPIA2.0在线平台分析结果显示,与正常乳腺组织相比,PTX3 mRNA在乳腺癌组织中低表达.UALCAN数据库分析结果显示,PTX3 mRNA表达与年龄、TNM分期、淋巴结转移数、TP53突变有关.Kaplan-Meier Plotter数据库分析结果显示,PTX3 mRNA高表达的乳腺癌患者的总体生存期(HR=0.8,95%CI:0.65~0.97,P=0.026)和无进展生存期(HR=0.89,95%CI:0.8~0.99,P=0.032)更长.在Luminal A型、基底样型乳腺癌患者中,PTX3 mRNA高表达的人群总生存期更长.同时,在Luminal A型、基底样型以及Luminal B型乳腺癌患者中,PTX3 mRNA高表达的人群无进展生存期更长;STRING蛋白相互作用网络分析显示,PTX3蛋白相互作用网络包括FGF2、FCN1、CFH、FCN2、TNFAIP6、SELP、MBL2、C1QA、CFHR1主要参与免疫调节作用以及炎症,部分蛋白可调节细胞存活、细胞分裂、血管生成、细胞分化和细胞迁移.CancerSEA数据库分析结果显示,PTX3基因的表达与炎症反应呈显著正相关(P<0.001),与转移、干细胞特性、组织缺氧呈显著负相关(均P<0.001).结论:PTX3在乳腺癌组织中低表达,与年龄、肿瘤分级、淋巴结转移数、TP53突变相关,且PTX3 mRNA高表达乳腺癌患者生存预后较好,主要参与免疫调节作用以及炎症、调节细胞存活、细胞分裂、血管生成、细胞分化和细胞迁移等.
文献关键词:
乳腺癌;PTX3;生物信息;基因表达
作者姓名:
赵雅雯;马勇杰
作者机构:
天津医科大学肿瘤医院肿瘤细胞生物学实验室,国家肿瘤临床医学研究中心,天津市恶性 肿瘤临床医学研究中心,乳腺癌防治教育部重点实验室,天津市"肿瘤防治"重点实验室,天津 300060
引用格式:
[1]赵雅雯;马勇杰-.基于生物信息学分析PTX3基因在乳腺癌中的表达及临床意义)[J].天津医科大学学报,2022(06):577-584
A类:
CancerSEA,FCN1,FCN2,SELP,CFHR1
B类:
生物信息学分析,PTX3,生物信息数据库,TIMER,GEPIA2,常乳,乳腺组织,癌组织,UALCAN,Kaplan,Meier,Plotter,数据库分析,STRING,数据库构建,细胞功能,功能状态,在线平台,低表达,TNM,淋巴结转移数,TP53,乳腺癌患者,总体生存期,无进展生存期,Luminal,底样,总生存期,蛋白相互作用网络分析,FGF2,TNFAIP6,MBL2,C1QA,免疫调节作用,可调节,细胞存活,细胞分裂,血管生成,细胞分化,细胞迁移,干细胞特性,组织缺氧,肿瘤分级,变相,生存预后
AB值:
0.228069
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