目的 旨在寻找与浸润性乳腺癌(BRCA)发生相关的肿瘤微环境(TME)相关基因,以预测其预后并为临床提供治疗靶点.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中检索到RNA转录组数据和临床相关数据.利用ESTIMATE算法计算基质评分和免疫评分.然后通过取交集筛选出差异表达基因(DEGs).利用蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络和单变量COX回归分析来确定DEGs中的核心基因.选取一个核心基因进行GSEA集富集分析和CIBERSORT分析,以分别区分核心基因表达的功能和肿瘤浸润免疫细胞(TICs)的比例.最终用Western blot和qRT-PCR对CD40LG的表达水平进行临床验证.结果 从TCGA中提取了1222个样本(124个正常样本和1098个肿瘤样本)进行分析,共获得了487个DEG.这些基因主要富集在与免疫相关的途径中.进一步的交叉分析揭示了11个关键基因,包括CD40LG、ITK、CD5、CD3E、SPN、IL7R、CD48、CCL19、CD2、CD52和CD2711,这些基因被证明与乳腺癌TME状态相关.挑选了CD40LG进行进一步研究,结果表明,CD40LG高表达BRCA患者的总生存期(OS)比低表达BRCA患者更长(P=0.002),并且CD40LG表达在TNM分期、肿瘤大小方面的差异也具有统计学意义(P<0.05).GSEA和CIBERSORT分析表明CD40LG的表达与TME中的免疫活性有关.Western blot和qRT-PCR结果显示CD40LG在乳腺癌细胞及癌组织中的蛋白及mRNA表达量均低于乳腺正常细胞及癌旁组织(P<0.05).结论 CD40LG在TME中高表达与BRCA患者的生存呈正相关,所以CD40LG可能是一种新的用于预后预测的生物标志物.其生物学行为可能促进我们对肿瘤进展的分子机制和靶向治疗的理解.

乳腺癌;肿瘤微环境;癌症基因组图谱;肿瘤浸润免疫细胞;CD40LG

郭丽;马银玲;李婷;李金平

宁夏医科大学,宁夏 银川750000;宁夏医科大学总医院,宁夏 银川 750000

南方医科大学学报

[1]郭丽;马银玲;李婷;李金平-.CD40LG是与浸润性乳腺癌肿瘤微环境中免疫和基质相关的预后标志物)[J].南方医科大学学报,2022(09):1267-1278

CD2711

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