典型文献
泛癌分析长链非编码RNA MIR22HG的表达特征
文献摘要：
目的 泛癌分析长链非编码RNA(lncRNA)MIR22HG的表达及其与临床特征的关系.方法 R语言分析癌症基因组图谱(TCGA)中MIR22HG在不同肿瘤组织中的表达及其与临床分期、淋巴结转移、肿瘤突变负荷(TMB)及微卫星不稳定(MSI)的关系;应用TIMER比较MIR22HG表达与免疫浸润的关系;使用cBioPortal分析MIR22HG的突变频率及其与预后的关系;使用GDSC在线数据库分析MIR22HG与化疗药物敏感性的关系.利用GEO数据库肝癌数据集和12对肝癌标本验证MIR22HG在肝癌中的表达及其与索拉非尼治疗反应的关系;分析MIR22HG表达与索拉非尼治疗预后的关系;在肝癌细胞株HCC-LM3中过表达MIR22HG(NC组,MIR22HG过表达组),在肝癌细胞株MHCC-97H中敲除MIR22HG(NC组,sh-MIR22HG组),采用CCK-8检测肝癌细胞中MIR22HG对索拉非尼IC50的影响.结果 MIR22HG在大多数肿瘤中低表达(P<0.05),且多数肿瘤中MIR22HG基因存在缺失突变,其突变与肿瘤不良预后相关(P<0.05).MIR22HG的表达水平与多种肿瘤的临床分期及淋巴结转移相关(P<0.05).在多种肿瘤中MIR22HG的表达水平与TBM、MSI、免疫评分、免疫检查点相关基因表达及化疗药的药物敏感性显著相关(P<0.05).6种常见免疫细胞中,中性粒细胞浸润水平与MIR22HG的表达水平相关性最强,尤其在乳腺癌、直肠癌及肾乳头状细胞癌中明显.多个数据集的分析结果验证MIR22HG在肝癌中低表达,且其低表达与肝癌进展相关(P<0.05).MIR22HG低表达的患者经索拉非尼治疗后预后较好(HR=2.94,P=0.075),其低表达能有效预测肝癌患者索拉非尼治疗效果(AUC=0.8095).过表达MIR22HG能降低肝癌细胞对索拉非尼的敏感性(IC50 NC vs IC50 MIR22HG=7.731 vs 15.61);而敲除MIR22HG的表达则能增加肝癌细胞对索拉非尼的敏感性(IC50 NC vs IC50sh-MIR22HG=7.986 vs 5.085).结论 MIR22HG的表达与多种肿瘤的分期、有否淋巴结转移、肿瘤突变负荷、微卫星不稳定、免疫细胞浸润及化疗药物敏感性相关.
文献关键词：
长链非编码RNA;MIR22HG;泛癌分析;肝癌;索拉非尼
中图分类号：
作者姓名：
王惠;黎雯雯;张冬艳
作者机构：
南方医科大学南方医院放疗科,广东 广州 510515;南方医科大学南方医院肝病中心,广东 广州 510515
文献出处：
引用格式：
[1]王惠;黎雯雯;张冬艳-.泛癌分析长链非编码RNA MIR22HG的表达特征)[J].南方医科大学学报,2022(04):473-485
A类：
IC50sh
B类：
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AB值：
0.211947
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