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基于WGCNA和分子对接分析干姜黄芩黄连人参汤干预胃腺癌的成分及靶点
文献摘要：
目的 基于加权基因共表达网络分析(WGCNA)和分子对接研究干姜黄芩黄连人参汤干预胃腺癌的成分及靶点.方法 从中药系统药理学数据库与分析平台中筛选与药物相关的成分和靶点,构建药物-化合物-靶标相互作用网络.在TCGA数据库下载胃腺癌基因表达数据,筛选与胃腺癌风险等级相关的关键模块,利用GO和KEGG数据库分析关键模块所包含基因的生物学功能.将模块基因上传到STRING数据库筛选关键靶点,通过分子对接技术对关键靶点进行半柔性对接反向验证.结果 筛选得到59个活性成分,184个靶点,药物-化合物-靶点相互作用网络得到242个节点,676条边.通过WGCNA筛选出的关键模块共包括32个基因.GO和KEGG富集的结果主要涉及DNA完整性检验点、对金属离子的反应、p53信号通路、细胞周期和细胞衰老等.筛选得到的关键靶点为VEGFA、CDK1、CCND1.通过分子对接表明槲皮素、汉黄芩素、黄芩素等化合物与关键靶点结合活性较高.结论 多种活性成分可以与胃腺癌的靶点相结合起到调节作用.
文献关键词：
胃腺癌;网络药理学;加权基因共表达网络分析;分子对接
中图分类号：
作者姓名：
孙倩;杨美子;栾继昕;李森;张帆
作者机构：
山东省聊城市人民医院临床药学科,山东聊城 252000;滨州医学院药理学教研室,山东烟台 264003;山东第一医科大学研究生院,山东泰安 271000;山东省聊城市人民医院内分泌科,山东聊城 252000
文献出处：
引用格式：
[1]孙倩;杨美子;栾继昕;李森;张帆-.基于WGCNA和分子对接分析干姜黄芩黄连人参汤干预胃腺癌的成分及靶点)[J].中国医药导报,2022(03):18-23
A类：
干姜黄芩黄连人参汤
B类：
WGCNA,胃腺癌,加权基因共表达网络分析,对接研究,系统药理学,分析平台,靶标,相互作用网络,TCGA,下载,癌基因,基因表达数据,风险等级,数据库分析,生物学功能,传到,STRING,选关,关键靶点,分子对接技术,反向验证,选得,活性成分,完整性检验,金属离子,p53,细胞周期,细胞衰老,VEGFA,CDK1,CCND1,槲皮素,汉黄芩素,结合活性,网络药理学
AB值：
0.245163
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