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基于网络药理学和分子对接法探索白及三七药对修复糖尿病足的作用机制
文献摘要：
目的 基于网络药理学及分子对接法探索白及三七药对修复糖尿病足(DF)的作用机制.方法 采用中药系统药理学分析数据库(TCMSP)、SymMap数据库和BATMAN-TCM数据库筛选白及、三七的化学成分和作用靶点;通过检索毒性与基因比较数据库(CTD)、人类孟德尔遗传研究平台(OMIM)和人类基因信息数据库(GeneCards)选取DF靶点并筛选药物与疾病共同靶点;用UniProt数据库对疾病和药物靶点进行标准化命名,并使用STRING平台构建蛋白质间相互作用网络(PPI),利用cytoHubba插件选出排名前30的Hub基因;利用Cytoscape 3.6.0软件构建药物-成分-靶点网络图;利用cluster profile R包对核心靶点进行基因本体(GO)富集分析,京都基因与基因组百科全书(KEGG)进行通路富集分析;运用AutoDock Vina对核心活性成分与核心靶点进行分子对接验证.结果 从白及三七药对中得到了102个主要活性化合物,164个药物-疾病共有靶点,主要活性化合物为槲皮素、鬼伞菌素,邻苯二甲酸二正辛酯、3,4-二甲基苯甲酸、棕榈酸等;核心靶点主要为白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤抑制蛋白(TP53)、白细胞介素-1β(IL-1β)、肿瘤坏死因子(TNF)、一氧化氮合酶3(NOS3)、胰岛素样生长因子1、人内皮素1、趋化因子2等;GO富集分析得到5597条生物过程,KEGG富集分析得到273条信号通路,主要涉及AGE-RAGE、MAPK、HIF-1等信号通路;分子对接结果显示核心活性成分与核心靶点之间具有较好的结合能.结论 白及三七药对中的槲皮素、鬼伞菌素、邻苯二甲酸二正辛酯、3,4-二甲基苯甲酸等活性成分可能通过调节TNF、TP53、NOS3、IL-6等蛋白,作用于AGE-RAGE、MAPK、HIF-1等信号通路,发挥抑制炎症反应、促进细胞增殖分化、抗细胞凋亡、促血管内皮生成、参与免疫调节等作用,从而达到修复DF的效果.
文献关键词：
糖尿病足;白及;三七;网络药理学;分子对接
中图分类号：
作者姓名：
颉玙;张金梅;张敏;雷霆
作者机构：
陕西中医药大学,陕西 咸阳 712000;陕西中医药大学附属医院,陕西 咸阳712000
文献出处：
引用格式：
[1]颉玙;张金梅;张敏;雷霆-.基于网络药理学和分子对接法探索白及三七药对修复糖尿病足的作用机制)[J].现代中西医结合杂志,2022(17):2400-2409
A类：
鬼伞菌素
B类：
网络药理学,分子对接法,白及,三七,药对,糖尿病足,DF,系统药理学,药理学分析,TCMSP,SymMap,BATMAN,作用靶点,CTD,孟德尔遗传,遗传研究,研究平台,OMIM,人类基因,基因信息,信息数据库,GeneCards,UniProt,药物靶点,STRING,平台构建,蛋白质间相互作用,相互作用网络,PPI,cytoHubba,插件,Cytoscape,软件构建,靶点网络,网络图,cluster,profile,核心靶点,基因本体,京都基因与基因组百科全书,通路富集分析,AutoDock,Vina,活性成分,活性化合物,槲皮素,邻苯二甲酸,二甲基,苯甲酸,棕榈酸,肿瘤抑制,TP53,一氧化氮合酶,NOS3,胰岛素样生长因子,内皮素,趋化因子,生物过程,RAGE,MAPK,HIF,结合能,抑制炎症,细胞增殖分化,抗细胞凋亡,血管内皮,免疫调节
AB值：
0.321992
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