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磷脂酰肌醇聚糖锚定生物合成类U在卵巢癌组织中的表达及临床意义的生物信息学分析
文献摘要：
目的 通过生物信息学分析糖基磷脂酰肌醇转氨酶(GPI-T)复合物相关基因磷脂酰肌醇聚糖锚定生物合成类U(PIGU)在卵巢癌组织中的表达及临床意义.方法 通过癌症基因组图谱(TCGA)、基因型-组织表达(GTEx)数据库下载279例卵巢癌患者卵巢癌组织及88例卵巢正常组织的全基因组的表达量矩阵,对GPI-T复合物相关基因进行差异分析.利用Kaplan-Meier Plotter(KMPLot)网页工具进行生存分析,利用基因表达综合(GEO)数据库进一步验证PIGU在卵巢癌中的重要意义.利用GeneMANIA网站预测PIGU的蛋白质相互作用网络,使用WebGestalt网页工具对PIGU及其关键互作分子进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析.结果 与卵巢正常组织相比,卵巢癌组织中磷脂酰肌醇聚糖锚定生物合成类S(PIGS)表达明显下调,磷脂酰肌醇聚糖锚定生物合成类K(PIGK)、PIGU、磷脂酰肌醇聚糖锚定生物合成类T(PIGT)、糖基磷脂酰肌醇锚定附着蛋白1(GPAA1)的表达均明显上调,差异均有统计学意义(P﹤0.01).PIGU的表达与卵巢癌患者的总生存期(OS)、无进展生存期(PFS)均有关(P﹤0.05),PIGU高表达卵巢癌患者的OS、PFS均低于PIGU低表达患者,差异均有统计学意义(P﹤0.05).GeneMANIA网站预测PIGU的蛋白质相互作用网络,结果发现了包括PIGS、PIGK、PIGT、GPAA1在内的20个关键互作分子.KEGG分析通路分析揭示了PIGU及其关键互作分子的潜在分子机制,证实PIGU通过参与调控生物合成与代谢通路,影响卵巢癌的发生发展.结论 PIGU在卵巢癌组织中高表达,可以作为预测卵巢癌发生、发展及患者预后的标志物之一.
文献关键词：
磷脂酰肌醇聚糖锚定生物合成类U;卵巢癌;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
陈琳;傅芬;陈秋连
作者机构：
新余市人民医院产科,江西 新余 338000;南昌大学第二附属医院妇产科,南昌 3300060
文献出处：
引用格式：
[1]陈琳;傅芬;陈秋连-.磷脂酰肌醇聚糖锚定生物合成类U在卵巢癌组织中的表达及临床意义的生物信息学分析)[J].癌症进展,2022(16):1682-1686
A类：
PIGU,KMPLot,PIGS,PIGK,PIGT,GPAA1
B类：
磷脂酰肌醇,锚定,卵巢癌组织,生物信息学分析,糖基磷脂,转氨酶,GPI,复合物,癌症基因组图谱,TCGA,基因型,组织表达,GTEx,下载,卵巢癌患者,正常组织,全基因组,Kaplan,Meier,Plotter,网页,生存分析,GEO,GeneMANIA,蛋白质相互作用网络,WebGestalt,京都基因与基因组百科全书,总生存期,OS,无进展生存期,PFS,低表达,通路分析,生物合成与代谢,代谢通路
AB值：
0.161257
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