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典型文献
ANLN是与免疫浸润相关的新型肾透明细胞癌预后标记物
文献摘要:
目的:研究肌动蛋白结合蛋白(ANLN)在肾透明细胞癌(ccRCC)中的表达情况,分析其表达量与预后及免疫浸润的相关性.方法:用癌症基因组图谱(TCGA)的ccRCC的测序数据分析ANLN在ccRCC中的mRNA表达水平及其与临床病理特征和生存预后的关系,并用我院10对癌及癌旁组织进行实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)验证.通过CPTAC数据库分析ANLN蛋白表达水平在癌和癌旁组织中的差异.通过人类蛋白质图谱数据库(HPA)比较ANLN在ccRCC和癌旁组织的免疫组化数据.通过基因集富集分析(GSEA),探索ANLN可能参与的生物学功能.此外,我们还利用外部数据集E-MTAB-1980对上述分析进行验证.最后通过TIMER数据库探索ANLN与免疫细胞的相关性.结果:TCGA数据库及CPTAC数据库分析与qRT-PCR结果均提示ANLN在ccRCC中高表达.且ANLN基因表达在不同性别、肿瘤病理分级、临床分期、T分期、M分期及不同分子亚型中均有显著差异.ANLN高表达的ccRCC患者预后不良,差异有统计学意义(P<0.001).单因素和多因素Cox回归分析显示,ANLN可以作为ccRCC的独立预后因子.GSEA分析表明,ANLN可能参与免疫反应等生物学过程.此外,ANLN表达量还与6种免疫细胞浸润水平存在显著相关性,其中与巨噬细胞相关性较高.结论:ANLN在ccRCC中的高表达与临床特征关系紧密,ANLN高表达的ccRCC患者预后差,且可以作为ccRCC的独立预后因子.此外,ANLN还与巨噬细胞的浸润水平存在相关性,提示其与肿瘤免疫微环境密切相关.
文献关键词:
肌动蛋白结合蛋白;肾透明细胞癌;生信分析;免疫浸润;预后标记物
作者姓名:
史晓凯;高生林;岳闯;陈寅;左立
作者机构:
南京医科大学附属常州第二人民医院泌尿外科 江苏常州,213000
引用格式:
[1]史晓凯;高生林;岳闯;陈寅;左立-.ANLN是与免疫浸润相关的新型肾透明细胞癌预后标记物)[J].临床泌尿外科杂志,2022(10):753-760
A类:
B类:
ANLN,免疫浸润,肾透明细胞癌,预后标记物,肌动蛋白结合蛋白,ccRCC,癌症基因组图谱,TCGA,序数,临床病理特征,生存预后,我院,癌旁组织,实时荧光定量聚合酶链反应,qRT,CPTAC,数据库分析,蛋白表达水平,类蛋白质,谱数据,HPA,免疫组化,基因集富集分析,GSEA,生物学功能,外部数据,MTAB,TIMER,肿瘤病,病理分级,临床分期,不同分子亚型,预后不良,Cox,预后因子,免疫反应,生物学过程,免疫细胞浸润,显著相关性,巨噬细胞,特征关系,系紧,肿瘤免疫微环境,生信分析
AB值:
0.238037
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