典型文献
卵巢癌发生和预后关键基因的生物信息学分析
文献摘要：
目的 从TCGA和GTEX数据库分析卵巢癌中的异常表达及与预后相关的基因.方法 利用GEPIA生物信息学分析平台对TCGA数据库和GTEX数据库中卵巢癌与正常组织的关键差异mRNA进行分析.利用R软件进行基因本体富集分析和通路分析,筛选异常表达和与预后相关的基因.结果 共鉴定出差异表达基因7638个,其中上调基因2622个,下调基因5016个.前10位上调的基因包括CLDN3、WFDC2、SLPI、FOLR1、MSLN、CD24、S100A1、CLDN4、LCN2和KRT7,前10位下调的基因包括AL162151.3、STAR、MEG3、DLK1、PROK1、C7、WFIKKN2、DIO3OS、MIR202HG和PLA2G2A.在100个与卵巢癌总生存时间最相关的基因中,PI3、CACNA1C、RPS6KA2、RIPK4、TPT1、SORCS2、CXCL11、CXCL13、SELL、ADAMDEC1的表达存在显著差异.其中PI3和RIPK4 mRNA在卵巢癌中高表达,生存分析提示高表达与预后不良有关.结论 PI3和RIPK4 mRNA在卵巢癌中高表达,与卵巢癌的预后密切相关.它们有可能成为卵巢癌诊断的生物标志物或治疗靶点.
文献关键词：
卵巢癌;生物信息学;预后;差异表达;生存时间;PI3;RIPK4
中图分类号：
作者姓名：
吴茜;周武碧;戴京京
作者机构：
南京医科大学附属淮安第一医院检验科,江苏 淮安 223300;南京医科大学附属淮安第一医院病理科,江苏 淮安 223300
文献出处：
引用格式：
[1]吴茜;周武碧;戴京京-.卵巢癌发生和预后关键基因的生物信息学分析)[J].标记免疫分析与临床,2022(06):987-992
A类：
WFDC2,AL162151,DLK1,PROK1,WFIKKN2,DIO3OS,MIR202HG,PLA2G2A,RPS6KA2,RIPK4,SORCS2
B类：
卵巢癌,关键基因,生物信息学分析,TCGA,GTEX,数据库分析,异常表达,GEPIA,分析平台,正常组织,基因本体,富集分析,通路分析,出差,差异表达基因,CLDN3,SLPI,FOLR1,MSLN,CD24,S100A1,CLDN4,LCN2,KRT7,STAR,MEG3,C7,总生存时间,PI3,CACNA1C,TPT1,CXCL11,CXCL13,SELL,ADAMDEC1,生存分析,预后不良,生物标志物,治疗靶点
AB值：
0.377806
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