首站-论文投稿智能助手
典型文献
DHCR7基因在膀胱癌中的表达及其与临床特征及预后关系的生物信息学分析
文献摘要:
目的 采用生物信息学技术研究7-脱氢胆固醇还原酶(DHCR7)在膀胱癌中的表达及其与临床预后的关系等.方法 采用TCGA、GEO数据库分析膀胱癌与正常膀胱组织中DHCR7基因的表达,利用Hu-man Protein Atlas数据库验证DHCR7蛋白在膀胱癌组织中的表达,通过Kaplan Meier法分析DHCR7基因表达水平与膀胱癌患者预后及生存情况之间的关系;应用GeneMANIA数据库构建蛋白质互作网络(PPI),并通过GEPIA2分析互作基因在膀胱癌中的相关性;依据DHCR7基因mRNA相对表达水平,应用GSEA 4.1.0软件对TCGA数据进行分层基因富集分析.结果 膀胱癌组织中DHCR7基因mRNA相对表达水平明显高于癌旁组织及正常膀胱组织,差异有统计学意义(P<0.05);不同肿瘤分期、分级、分子分型膀胱癌组织中DHCR7基因mRNA相对表达水平比较,差异有统计学意义(P<0.05);与DHCR7低表达组相比,DHCR7高表达组的总生存期、肿瘤特异性生存期、无进展生存期更低,差异有统计学意义(P<0.05);PPI及基因富集分析显示DHCR7基因功能主要与胆固醇稳态、MTORC1通路等有关.结论 DHCR7基因在膀胱癌中高表达,与临床不良预后密切相关,DHCR7基因可能通过多种机制参与肿瘤发展过程,有望成为膀胱癌干预治疗、预后评估新的靶点.
文献关键词:
7-脱氢胆固醇还原酶;膀胱癌;预后;生物信息学
作者姓名:
赵路;周洋;黄君富;任章银
作者机构:
中国人民解放军陆军军医大学第一附属医院检验科,重庆 400038
引用格式:
[1]赵路;周洋;黄君富;任章银-.DHCR7基因在膀胱癌中的表达及其与临床特征及预后关系的生物信息学分析)[J].国际检验医学杂志,2022(21):2649-2654
A类:
DHCR7,MTORC1
B类:
预后关系,生物信息学分析,生物信息学技术,还原酶,临床预后,TCGA,GEO,数据库分析,Hu,man,Protein,Atlas,癌组织,Kaplan,Meier,基因表达水平,膀胱癌患者,生存情况,GeneMANIA,数据库构建,蛋白质互作网络,PPI,GEPIA2,互作基因,相对表达,GSEA,基因富集分析,癌旁组织,肿瘤分期,分子分型,低表达,总生存期,肿瘤特异性生存期,无进展生存期,基因功能,胆固醇稳态,不良预后,肿瘤发展,干预治疗,预后评估
AB值:
0.268635
相似文献
机标中图分类号,由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成,仅供学习研究参考。