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典型文献
MiR⁃206调控DDX3X促进胰腺癌不良预后及其机制的分析
文献摘要:
目的 研究miR?206在胰腺癌(PAAD)中表达和关键靶基因预测,分析靶基因DDX3X在PAAD中表达及突变与预后的关系,研究其在PAAD恶性进展中的分子机制.方法 利用TCGA公共数据集进行生物信息学分析,比较miR?206在PAAD样本和正常样本的表达差异.通过starBase、TargetScan和miRDB在线数据库对PAAD中miR?206的靶基因进行预测,并用韦恩图整合了重叠基因.PPI分析获得评分最高模块的基因,确定关键候选靶基因.利用卡方检验分析DDX3X与患者肿瘤远处转移的关系.通过Kaplan?Meier法分析DDX3X在PAAD中的预后价值.利用KEGG和GO分析探索DDX3X参与的分子通路.结果 与正常组织比较,miR?206在PAAD组织表达下调,差异有统计学意义(P<0.05);筛选出369个基因作为miR?206的潜在靶标;PPI评分最高模块中的14个靶基因作为miR?206在PAAD起关键调控作用的候选基因;靶基因DDX3X在PAAD的突变率为1.1%,与患者不良预后的高风险有关.DDX3X在PAAD组织中表达显著上调,差异有统计学意义(P<0.05),且DDX3X高表达与PAAD患者差的总体生存率相关(HR=1.6,P<0.05);DDX3X与远处转移显著相关(P<0.05);DDX3X高表达与较差的OS有关(HR=1.61,95%CI:1.05~2.48,Logrank P<0.05).靶基因DDX3X的GO分析发现其可能在蛋白磷酸化、核斑点和转录共激活因子活性等中发挥重要作用;在KEGG数据集中,对靶基因DDX3X显著富集的信号通路分析预测,其主要参与了细胞周期、胰腺癌和调节干细胞多能性、TGF?β、FoxO、MAPK等信号通路的调控,大多与肿瘤相关信号通路有关(P<0.05).结论 MiR?206的低表达水平使DDX3X在PAAD中显著上调,可通过多条分子通路调控PAAD的发生发展,DDX3X可作为PAAD潜在的新型标志物.
文献关键词:
胰腺癌;MiR-206;TCGA;预后;DDX3X
作者姓名:
段怡平;陈梁玥;朱翠雯;马甜甜;李东旭;柳家翠;赵允畅;朱光庭;喻明霞
作者机构:
武汉大学中南医院检验科,湖北,武汉430071;武汉大学第二临床学院,湖北,武汉430071
引用格式:
[1]段怡平;陈梁玥;朱翠雯;马甜甜;李东旭;柳家翠;赵允畅;朱光庭;喻明霞-.MiR⁃206调控DDX3X促进胰腺癌不良预后及其机制的分析)[J].分子诊断与治疗杂志,2022(02):222-227
A类:
B类:
MiR,DDX3X,胰腺癌,不良预后,PAAD,关键靶基因,靶基因预测,恶性进展,TCGA,公共数据,生物信息学分析,表达差异,starBase,TargetScan,miRDB,韦恩图,重叠基因,PPI,卡方检验,检验分析,远处转移,Kaplan,Meier,预后价值,分析探索,分子通路,正常组织,组织表达,靶标,候选基因,突变率,组织中表达,总体生存率,率相关,OS,Logrank,蛋白磷酸化,斑点,转录共激活因子,对靶,通路分析,分析预测,细胞周期,TGF,FoxO,MAPK,肿瘤相关,低表达,多条
AB值:
0.283246
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