典型文献
膀胱癌中TFAP2 C的表达及预后相关性分析
文献摘要：
目的:应用生物信息学方法和实验验证确定转录因子TFAP2C在人类膀胱癌中的作用.方法:通过TCGA、Oncomine、GEPIA、The Human Protein Altas和Kaplan-Meier Plotter等数据库获得膀胱癌患者TFAP2C的转录信息和生存数据,分析TFAP2C在膀胱癌组织中的表达水平及与预后的关系.在si-TFAP2C转染膀胱癌5637细胞后,利用CCK8和划痕实验检验TFAP2C在膀胱癌细胞中的作用.用STRING数据库构建蛋白互作网络,用R软件对网络中的基因进行GO和KEGG富集分析,通过R软件将TFAP2C在TCGA膀胱癌样本中的表达情况进行GSEA富集分析并作免疫细胞浸润相关性分析.结果:TFAP2C在膀胱癌组织中高表达,且其高表达预示着膀胱癌患者的总体生存率较差(P<0.05).划痕和CCK8实验证明了TFAP2C可促进膀胱癌细胞的增殖和迁移(P<0.05).GSEA结果显示,TFAP2C的高表达样本富集于蛋白质分泌、有丝分裂纺锤体、PI3K/AKT/mTOR信号通路和mTORC1信号通路(FDR<0.1,|NES|>1,P<0.05).KEGG信号通路分析显示:TFAP2C与相关基因主要通路富集于ErbB信号通路、EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药性和膀胱癌等(P<0.05).GO功能富集分析显示:TFAP2C与相关基因的生物学过程主要富集于转录共激活因子活性、转录辅助调节因子活性和表皮生长因子受体结合等(P<0.05).结论:TFAP2C在膀胱癌中起促癌作用,表达水平上调和预后不良有关,TFAP2C可能是判断膀胱癌预后的生物标志物.
文献关键词：
膀胱癌;生物信息学;TFAP2C;数据库;预后
中图分类号：
作者姓名：
陈康;邢基;朱少明;张云龙;程帆
作者机构：
武汉大学人民医院泌尿外科,湖北 武汉 430061
文献出处：
引用格式：
[1]陈康;邢基;朱少明;张云龙;程帆-.膀胱癌中TFAP2 C的表达及预后相关性分析)[J].现代肿瘤医学,2022(17):3172-3177
A类：
TFAP2,Altas
B类：
预后相关性分析,生物信息学方法,TFAP2C,TCGA,Oncomine,GEPIA,Human,Protein,Kaplan,Meier,Plotter,膀胱癌患者,癌组织,si,转染,CCK8,划痕实验,膀胱癌细胞,STRING,数据库构建,蛋白互作网络,GSEA,免疫细胞浸润,预示,总体生存率,细胞的增殖,增殖和迁移,蛋白质分泌,有丝分裂,纺锤体,PI3K,AKT,mTORC1,FDR,NES,通路分析,通路富集,ErbB,EGFR,酪氨酸激酶抑制剂,耐药性,功能富集分析,生物学过程,转录共激活因子,调节因子,表皮生长因子受体,促癌作用,预后不良,膀胱癌预后,生物标志物
AB值：
0.294659
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