典型文献
MMP14在胰腺癌中的表达及其与肿瘤免疫微环境特征的相关性研究
文献摘要:
目的 ·探究基质金属蛋白酶14(matrix metalloproteinase 14,MMP14)在胰腺癌组织中的表达及其与临床特征的相关性,并分析其与胰腺癌肿瘤免疫微环境特征的相关性.方法 ·通过GEPIA(Gene Expression Profiling Interactive Analysis)数据平台分析MMP家族成员在30种常见肿瘤组织中的表达情况.通过R语言整合GTEx(Genotype-Tissue Expression)数据库中167例胰腺正常组织和TCGA(The Cancer Genome Atlas)数据库中178例胰腺癌组织及4例配对癌旁组织的转录组数据,比较MMP14在胰腺癌与正常组织及癌旁组织中的表达差异.使用GEPIA数据平台对不同MMP14表达水平胰腺癌患者进行生存分析.从TCGA数据库中下载178例胰腺癌患者的相关临床信息,应用Perl和R语言分析MMP14的表达与临床特征的相关性.应用R语言和GSEA v3.0进行京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析和基因本体论(Gene Ontology,GO)功能富集分析.采用CIBERSORT反卷积算法计算胰腺癌免疫微环境中各类免疫细胞亚群比例,分析MMP14的表达与各免疫细胞亚群比例的相关性.收集6例新鲜胰腺癌组织和配对癌旁组织,流式细胞术检测各类免疫细胞亚群;通过t-SNE降维与统计学分析,描述胰腺癌免疫微环境的特征.利用胰腺癌组织芯片进行多色荧光免疫组织化学实验,检测MMP14的表达与免疫细胞亚群的比例,验证生物信息学分析结果.结果 ·在生物信息学数据库中,与MMP家族其他成员相比,MMP14在多种肿瘤中高表达,且胰腺癌中MMP14的表达水平高于其他肿瘤;MMP14在胰腺癌中表达水平显著高于胰腺正常组织和癌旁组织(P=0.000),TNM分期Ⅱ期肿瘤MMP14表达水平显著高于Ⅰ期(P=0.012),病理组织学分级G2和G3期肿瘤MMP14显著高于G1期(均P=0.000).MMP14低表达组患者生存预后显著优于高表达组(P=0.033).KEGG和GO分析结果显示MMP14主要富集在胰腺癌和免疫相关通路.MMP14的表达水平与CD8+T细胞、单核细胞的比例呈负相关(均P<0.05),与巨噬细胞的比例呈正相关(P=0.000).流式细胞实验结果提示胰腺癌肿瘤微环境呈现免疫抑制性.多色荧光免疫组织化学实验结果显示,MMP14在肿瘤组织中表达水平显著高于癌旁组织(P=0.000),TNM分期较晚及病理组织学分级较高的肿瘤MMP14的表达水平也相对较高(均P<0.05).在MMP14高表达的肿瘤组织中,CD8+T细胞比例降低(P=0.001),巨噬细胞比例升高(P=0.000),与生物信息学分析结果一致.结论 ·与正常胰腺组织和癌旁组织相比,MMP14在胰腺癌中的表达显著升高且与患者不良预后相关;MMP14高表达的胰腺癌组织中CD8+T细胞比例降低,巨噬细胞比例升高;高表达MMP14的胰腺癌肿瘤微环境呈现高度免疫抑制性.
文献关键词:
胰腺癌;基质金属蛋白酶14;肿瘤免疫微环境;生物信息学分析;流式细胞术;多色荧光免疫组织化学法
中图分类号:
作者姓名:
许静轩;杜少倩;曹源;王红霞;黄伟翼
作者机构:
上海交通大学医学院附属第一人民医院肿瘤中心,上海 201600
文献出处:
引用格式:
[1]许静轩;杜少倩;曹源;王红霞;黄伟翼-.MMP14在胰腺癌中的表达及其与肿瘤免疫微环境特征的相关性研究)[J].上海交通大学学报(医学版),2022(03):312-322
A类:
多色荧光免疫组织化学法
B类:
MMP14,肿瘤免疫微环境,环境特征,基质金属蛋白酶,matrix,metalloproteinase,胰腺癌组织,癌肿,GEPIA,Expression,Profiling,Interactive,Analysis,肿瘤组织,GTEx,Genotype,Tissue,正常组织,TCGA,Cancer,Atlas,癌旁组织,转录组数据,表达差异,生存分析,下载,临床信息,Perl,语言分析,GSEA,v3,京都基因与基因组百科全书,Kyoto,Encyclopedia,Genes,Genomes,通路富集分析,基因本体论,Ontology,功能富集分析,CIBERSORT,反卷积算法,算法计算,免疫细胞亚群,流式细胞术,SNE,统计学分析,组织芯片,化学实验,生物信息学分析,TNM,病理组织学,组织学分级,G2,G3,G1,低表达,生存预后,免疫相关,相关通路,CD8+T,单核细胞,巨噬细胞,细胞实验,肿瘤微环境,免疫抑制,抑制性,组织中表达,胰腺组织,不良预后
AB值:
0.207261
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