典型文献
胰腺癌差异表达基因的筛选及其预后价值:生物信息学分析
文献摘要：
目的:基于生物信息学方法通过大样本挖掘胰腺导管腺癌(pancreatic ductal adenocarcinoma,PDAC)发生发展的关键基因.从公开生物数据库中挖掘PDAC的关键基因,探讨其在PDAC中的表达情况和预后价值,为PDAC的诊断和靶向治疗奠定理论基础.方法:从基因表达汇编(Gene Expression Omnibus,GEO)和癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库分别下载基因芯片数据GSE16515、GSE28735,GSE62452和TCGA-GTEx,通过R语言计算差异基因,寻找共同差异基因,并且GO富集分析和KEGG通路分析,构建蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,筛选关键基因,最后验证关键基因在PDAC中的表达情况以及与PDAC预后的关系.结果:总共鉴定了219个DEGs,其中139个表达上调,80个表达下调.最终筛选出10个PDAC关键基因,其中FN1、POSTN、VCAN、MMP1、EGF和ALB与PDAC不良预后显著相关(P<0.05),进一步发现VCAN联合ALB、MMP1和POSTN具有更高预测PDAC生存预后的价值.结论:通过公开生物数据库挖掘出的与PDAC预后显著相关的5个关键基因,为PDAC发病机制、临床诊断和治疗靶点的研究提供理论依据.
文献关键词：
胰腺导管腺癌;生物信息学;差异表达基因;关键基因
中图分类号：
作者姓名：
陈辉;刘鹏;王怀涛;周磊;谭晓冬
作者机构：
中国医科大学附属盛京医院普通外科,辽宁 沈阳 110000
文献出处：
引用格式：
[1]陈辉;刘鹏;王怀涛;周磊;谭晓冬-.胰腺癌差异表达基因的筛选及其预后价值:生物信息学分析)[J].现代肿瘤医学,2022(08):1425-1430
A类：
GSE28735
B类：
胰腺癌,差异表达基因,预后价值,生物信息学分析,生物信息学方法,大样本,胰腺导管腺癌,pancreatic,ductal,adenocarcinoma,PDAC,关键基因,生物数据库,靶向治疗,基因表达汇编,Gene,Expression,Omnibus,GEO,癌症基因组图谱,Cancer,Genome,Atlas,TCGA,别下,下载,基因芯片,GSE16515,GSE62452,GTEx,语言计算,差异基因,富集分析,通路分析,蛋白质相互作用,protein,interaction,PPI,选关,总共,DEGs,FN1,POSTN,VCAN,MMP1,EGF,ALB,不良预后,生存预后,挖掘出,诊断和治疗,治疗靶点
AB值：
0.383905
相似文献
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
