典型文献
miR-27a在原发性痛风关节炎患者中的表达水平及生物信息学分析
文献摘要:
目的 检测miR-27 a在原发性痛风性关节炎(PGA)患者的表达水平,运用生物信息学方法研究miR-27 a及其靶基因在PGA发生、发展过程中的作用.方法 采用实时荧光定量PCR检测miR-27 a在PGA患者外周血单个核细胞中的表达水平,应用UCSC基因组在线软件分析miR-27 a在不同物种间的保守性,采用TargetScan、miRDB和RNA22数据库进行靶基因预测,并结合GeneCards数据库,对痛风相关的靶基因进行GO富集分析和KEGG信号通路分析.结果 miR-27a在PGA患者中表达明显降低,其核苷酸序列在多物种间呈高度保守性.受miR-27a调控,且与PGA疾病相关的潜在靶基因包括MAPK14、RFX3、ABCA1、HS2ST1、ENPEP和CACNA2D3等.GO富集分析发现,miR-27a的靶基因参与细胞代谢调节及对外界刺激的反应等多种生物学功能.KEGG信号通路分析发现,miR-27 a的靶基因显著富集在MAPK信号通路、细胞因子-细胞因子受体相互作用、糖尿病通路和醛固酮控制的钠盐重吸收通路等.结论 miR-27 a可能通过调控多个与痛风发病相关的靶基因,参与多条信号通路的调节,从而参与痛风炎症免疫反应机制.
文献关键词:
miR-27a;痛风;靶基因;GO富集;KEGG信号通路
中图分类号:
作者姓名:
苟海梅;陈莹;徐磊;李九龙;郭晓兰;钟晓武
作者机构:
川北医学院附属医院检验科,四川南充 637000;川北医学院检验系,四川南充 637000;川北医学院转化医学研究中心,四川南充 637000;南充市第五人民医院检验科,四川南充 637100
文献出处:
引用格式:
[1]苟海梅;陈莹;徐磊;李九龙;郭晓兰;钟晓武-.miR-27a在原发性痛风关节炎患者中的表达水平及生物信息学分析)[J].检验医学与临床,2022(10):1297-1301
A类:
RNA22,RFX3,HS2ST1,ENPEP,CACNA2D3
B类:
27a,原发性痛风,痛风关节炎,生物信息学分析,痛风性关节炎,PGA,生物信息学方法,外周血单个核细胞,UCSC,种间,保守性,TargetScan,miRDB,靶基因预测,GeneCards,富集分析,通路分析,多物种,疾病相关,MAPK14,ABCA1,细胞代谢,代谢调节,生物学功能,细胞因子受体,醛固酮,钠盐,重吸收,风发,多条,炎症免疫反应,反应机制
AB值:
0.266586
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