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基于mRNA高通量测序筛选调控小鼠术后谵妄重要差异基因
文献摘要：
目的 基于高通量测序技术筛选小鼠海马组织中术后谵妄(POD)发生的相关重要差异基因.方法 将16只健康雌性C57小鼠随机分为术后谵妄(POD组)和对照组(CON组),每组8只.采用异氟烷麻醉下剖腹探查构建POD模型,术后多时间点行为学检测POD改变.于造模后24 h收集小鼠海马组织进行高通量测序,对显著差异基因进行基因本体(GO)分析及京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路数据库分析,采用RT-qPCR验证关键差异表达基因(DEGs).结果 相比于对照组,POD组共鉴定了105个DEGs,其中79个DEGs上调,26个DEGs下调;GO分析结果显示,主要富集的生物过程包括应激反应、代谢过程等,主要表达于细胞器、细胞膜,参与的分子过程涉及转录活性调节等.KEGG分析提示,通路主要富集于NF-κB、趋化因子、mTOR、FoxO和Hippo等信号通路;综合上述结果并结合RT-qPCR验证筛选出Cdkn1a、Nfkbia、Card14、Wnt3、Bcl2、Gng11、Grm3和Akt28个关键基因.结论 高通量测序筛选出的差异表达基因,可能通过NF-κB、趋化因子、mTOR等信号通路介导POD发生.
文献关键词：
术后谵妄;高通量测序;关键差异基因
中图分类号：
作者姓名：
饶耘菊;陈思雨;杨海红;巩固
作者机构：
西南医科大学临床医学院,四川泸州646000;西部战区总医院麻醉科,四川成都610083
文献出处：
引用格式：
[1]饶耘菊;陈思雨;杨海红;巩固-.基于mRNA高通量测序筛选调控小鼠术后谵妄重要差异基因)[J].四川医学,2022(12):1191-1196
A类：
Cdkn1a,Card14,Gng11,Grm3,Akt28
B类：
选调,术后谵妄,高通量测序技术,技术筛选,小鼠海马,海马组织,POD,雌性,C57,CON,异氟烷,剖腹探查,行为学检测,基因本体,京都基因和基因组百科全书,路数,数据库分析,qPCR,差异表达基因,DEGs,生物过程,应激反应,代谢过程,细胞器,细胞膜,转录活性,趋化因子,mTOR,FoxO,Hippo,Nfkbia,Wnt3,Bcl2,关键基因,关键差异基因
AB值：
0.287961
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