典型文献
基于高通量测序技术的胃癌患者肠道菌群变化特点
文献摘要：
目的 使用高通量测序技术检测胃癌患者肠道菌群,探讨其分布及菌群功能的特点.方法 根据纳入排除标准,选取2019至2021年在河北北方学院附属第一医院胃肠肿瘤外科就诊的42例胃腺癌患者为研究对象,同时招募性别、年龄匹配的30例健康志愿者为对照组,收集两组粪便样本并提取DNA,使用16S核糖体DNA扩增子焦磷酸测序分析微生物种群,PICRUSt2预测菌群功能差异.结果 与健康对照组相比,胃癌组患者拟杆菌门丰度减少,变形菌门和放线菌门丰度增加,差异均有统计学意义(t=4.491、3.369、2.790,P＜0.05);α多样性分析结果显示,胃癌患者Chao1指数升高而Shannon指数减少,差异均有统计学意义(t=10.884、9.953,P＜0.01);主坐标分析(PCoA)显示,胃癌组与对照组菌群结构存在差异.线性判别效应分析(LefSe)结果显示,在属水平上,胃癌患者大肠埃希菌-志贺菌属(Escherichia-Shigella)丰度显著高于对照组,而作为益生菌的拟杆菌属(Bacte-roides)、乳酸杆菌(Lactobacilli)显著低于对照组,差异均有统计学意义(线性判别分析值=3,P＜0.05).京都基因和基因组百科全书(KEGG)结果显示,胃癌患者与健康对照组间的菌群代谢存在差异.结论 胃癌患者肠道菌群多样性和结构均与健康人群不同,提示肠道菌群可能参与胃癌发生.
文献关键词：
胃癌;肠道菌群;高通量测序;埃希菌-志贺菌属;拟杆菌属;乳酸杆菌
中图分类号：
作者姓名：
黄迪;李飞;苏卓彬;梁占东;孙光源;高建朝;李曙光
作者机构：
河北北方学院附属第一医院胃肠肿瘤外科,河北张家口 075000
文献出处：
引用格式：
[1]黄迪;李飞;苏卓彬;梁占东;孙光源;高建朝;李曙光-.基于高通量测序技术的胃癌患者肠道菌群变化特点)[J].中国临床研究,2022(03):303-306
A类：
Lactobacilli
B类：
高通量测序技术,胃癌患者,肠道菌群变化,变化特点,菌群功能,排除标准,胃肠肿瘤外科,胃腺癌,招募,健康志愿者,粪便样本,16S,核糖体,扩增子,焦磷酸测序,测序分析,微生物种群,PICRUSt2,功能差异,拟杆菌门,变形菌门,放线菌,多样性分析,Chao1,Shannon,主坐标分析,PCoA,菌群结构,LefSe,大肠埃希菌,志贺菌,Escherichia,Shigella,益生菌,拟杆菌属,Bacte,roides,乳酸杆菌,线性判别分析,京都基因和基因组百科全书,肠道菌群多样性,健康人群
AB值：
0.314322
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