典型文献
GEO芯片联合网络药理学探究六味地黄丸治疗系统性红斑狼疮作用机制及核心靶点分析
文献摘要：
目的 运用网络药理学及生物信息学探究六味地黄丸治疗系统性红斑狼疮(SLE)的作用机制,并对核心靶点基因进行深入分析.方法 利用TCMSP、SwissTargetPrediction、本草组鉴(HERB)数据库检索六味地黄丸的主要活性成分及其相关靶点,通过R软件limma包对GEO数据库SLE数据集GSE49454进行差异分析.利用R软件VennDiagram包进行交集靶点分析,clusterProfiler包对交集靶点基因进行GO和KEGG通路富集分析.采用Cytoscape3.8.2软件进行活性成分-靶点-通路网络构建与分析.通过STRING平台构建蛋白相互作用网络并利用Cytoscape3.8.2软件筛选核心靶点基因.利用PyMOL软件对核心活性成分与核心靶点基因进行分子对接验证;通过临床数据与TRRUST数据库进行表达量、转录因子与免疫浸润分析.结果 共筛选出有效活性成分69个,相关靶点813个,基因芯片差异基因703个.KEGG通路富集分析显示,主要涉及NOD样受体等信号通路.筛选出5个核心成分(槲皮素、山柰酚、海风藤酮、玉兰脂素B、羟基芫花素)及5个核心靶点基因(TLR4、CCL2、PTPRC、CXCL10、MPO);分子对接显示,核心成分与核心靶点之间均具有稳定的结合能力.探寻到3个相关转录因子(SPI1、STAT1、NFKB1);免疫浸润分析表明,核心靶点基因与T细胞、中性粒细胞和NK细胞等关系密切.结论 六味地黄丸可能从抗炎、调节免疫细胞功能等方面发挥对SLE的治疗作用.
文献关键词：
六味地黄丸;系统性红斑狼疮;网络药理学;生物信息学;分子对接
中图分类号：
作者姓名：
孟祥文;贾晓益;陆志远;程芷洛;谭亚楠;张敏
作者机构：
安徽中医药大学药学院,安徽 合肥 230012;中国科学技术大学附属第一医院,安徽 合肥 230001
文献出处：
引用格式：
[1]孟祥文;贾晓益;陆志远;程芷洛;谭亚楠;张敏-.GEO芯片联合网络药理学探究六味地黄丸治疗系统性红斑狼疮作用机制及核心靶点分析)[J].中国中医药信息杂志,2022(11):5-11
A类：
GSE49454
B类：
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AB值：
0.324451
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