典型文献
基于网络药理学与分子对接技术探讨六味地黄丸治疗抑郁症的作用机制
文献摘要：
目的:采用网络药理学与分子对接技术研究六味地黄丸治疗抑郁症的作用机制.方法:采用中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)检索六味地黄丸组方中药的化学成分,利用TCMSP、PubChem数据库、BABEL软件、SwissTargetPrediction平台、SEA平台预测药物活性成分靶点;采用DisGeNET数据库获取抑郁症的靶点;运用Venn Diagram平台对六味地黄丸活性成分相关靶点及抑郁症疾病靶点进行映射,得到六味地黄丸治疗抑郁症的潜在作用靶点;将六味地黄丸治疗抑郁症的潜在作用靶点输入STRING数据库获取蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)关系,并将结果输入Cytoscape 3.2.1软件构建PPI网络,筛选出关键靶点.将潜在作用靶点与六味地黄丸相关活性成分导入Cytoscape 3.2.1软件,构建"药物活性成分-潜在靶点"网络图,筛选出关键成分;将潜在靶点输入FunRich软件进行富集分析.应用DockThor软件将PPI网络中度值首位的靶点蛋白分别与六味中药中拓扑分析参数首位的活性成分进行分子对接,使用PyMOL软件做出可视化图片.结果:获得六味地黄丸活性成分40个,相关靶点3 706个;抑郁症疾病靶点1 478个,六味地黄丸治疗抑郁症潜在靶点38个.PPI网络拓扑分析筛选得到丝裂原活化蛋白激酶3(mitogen-activated protein kinase 3,MAPK3)为首位关键靶点."药物活性成分-潜在靶点"网络拓扑分析筛选出关键成分为豆固醇、薯蓣皂苷、2,6,10,14,18-五甲基肼-2,6,10,14,18-五烯、丁子香萜等.将38个交集靶点输入FunRich软件进行富集分析,得到生物过程13个、细胞组分37个、分子功能15个及生物通路319条.分子对接显示6种活性成分均与MAPK3有较强的结合力.结论:六味地黄丸治疗抑郁症具有多通路、多成分、多靶点的特点.
文献关键词：
六味地黄丸;抑郁症;网络药理学;分子对接;作用机制
中图分类号：
作者姓名：
张俊霞;晁利芹;王付
作者机构：
河南中医药大学,河南郑州450046
文献出处：
引用格式：
[1]张俊霞;晁利芹;王付-.基于网络药理学与分子对接技术探讨六味地黄丸治疗抑郁症的作用机制)[J].中医学报,2022(08):1719-1726
A类：
BABEL,DockThor
B类：
网络药理学与分子对接,分子对接技术,技术探讨,六味地黄丸,抑郁症,系统药理学,分析平台,traditional,Chinese,medicine,systems,pharmacology,database,analysis,platform,TCMSP,组方,PubChem,SwissTargetPrediction,SEA,药物活性成分,活性成分靶点,DisGeNET,Venn,Diagram,潜在作用,作用靶点,STRING,蛋白相互作用,protein,interaction,PPI,Cytoscape,软件构建,关键靶点,潜在靶点,网络图,关键成分,FunRich,富集分析,靶点蛋白,数首,PyMOL,网络拓扑分析,选得,丝裂原活化蛋白激酶,mitogen,activated,kinase,MAPK3,豆固醇,薯蓣皂苷,五甲,甲基肼,交集靶点,生物过程,生物通路,结合力,多通路,多成分,多靶点
AB值：
0.260853
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