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典型文献
基于网络药理学和分子对接探讨二仙汤治疗卵巢早衰的作用机制
文献摘要:
目的:对二仙汤治疗卵巢早衰(premature ovarian failure,POF)作用机制进行探讨.方法:基于网络药理学和分子对接的方法,通过检索TCMSP数据库获取二仙汤中各药物的活性成分;通过GeneCards、OMIM、PharmGkb和Drugbank数据库收集卵巢早衰疾病靶点,将活性成分与疾病基因靶点取交集,得到二仙汤治疗卵巢早衰的预测靶点.采用Cytoscape 3.8.0构建"药物-成分-靶点-疾病"网络;通过STRING数据库和Cytoscape构建蛋白互作网络(PPI)及精简核心网络;运用R Studio软件对二仙汤治疗POF进行GO富集和KEGG通路富集分析.采用分子对接技术对"药物-成分-靶点-疾病"网络结果进行验证.结果:筛选出68个主要活性成分,涉及182个基因靶点,其中主要活性成分包括槲皮素(Quercetin)、木犀草素(Luteolin)、山柰酚(Kaempferol)等;核心靶点基因包括RB1、TP53、FOS、CDKN1A、ESR1、AKT1、MAPK1、TNF等;富集到GO生物过程(biological process,BP)2545条、细胞定位(cellular component,CC)89条、分子功能(molecular function,MF)212条;KEGG通路173条,包括PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路、糖尿病并发症中AGE-RAGE信号通路等信号通路.分子对接结果验证提示主要活性成分与核心靶点之间具有较好的结合活性.结论:本研究初步揭示了二仙汤治疗POF可能是通过多成分、多靶点、多途径协共同发挥作用,为接下来的深入研究提供参考.
文献关键词:
网络药理学;分子对接;二仙汤;卵巢早衰;作用机制
作者姓名:
李煜;黎小斌;曹晓静
作者机构:
广州中医药大学第二临床医学院,广东 广州 510405;广东省中医院,广东 广州 510105
文献出处:
引用格式:
[1]李煜;黎小斌;曹晓静-.基于网络药理学和分子对接探讨二仙汤治疗卵巢早衰的作用机制)[J].海南医学院学报,2022(14):1096-1107
A类:
B类:
网络药理学,二仙汤,卵巢早衰,premature,ovarian,failure,POF,TCMSP,GeneCards,OMIM,PharmGkb,Drugbank,疾病基因,基因靶点,交集,Cytoscape,STRING,蛋白互作网络,PPI,精简,核心网络,Studio,通路富集分析,分子对接技术,主要活性成分,分包,槲皮素,Quercetin,木犀草素,Luteolin,山柰酚,Kaempferol,核心靶点,靶点基因,RB1,TP53,FOS,CDKN1A,ESR1,AKT1,MAPK1,生物过程,biological,process,细胞定位,cellular,component,CC,molecular,function,MF,PI3K,Akt,糖尿病并发症,RAGE,结合活性,多成分,多靶点,多途径,接下来
AB值:
0.384048
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