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典型文献
基于网络药理学和分子对接探讨丹参-淫羊藿药对治疗慢性心力衰竭的作用机制
文献摘要:
目的:探究丹参-淫羊藿药对治疗慢性心力衰竭的作用机制.方法:利用网络药理学方法,借助中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、Uniprot数据库筛选出中药丹参、淫羊藿的活性成分及靶点信息.通过Disgenet、DrugBank、GeneCards等数据库筛选出慢性心力衰竭的靶点基因,利用Venny对中药活性成分和疾病靶点信息取交集,将共同靶点通过STRING数据平台建立蛋白质-蛋白质相互作用网络,并通过Cytoscape 3.7.1筛选出核心靶点.利用Metascape在线分析工具对交集靶点进行基因本体论(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析,并借助微生信作图网站展现分析结果.借助AutodockTools 1.5.7软件将药对中的主要活性成分与核心靶点进行对接,并将结果通过Pymol软件进行可视化.结果:两味中药共筛选出80个活性成分,221个作用靶点,筛选出慢性心力衰竭疾病靶点1918个,通过韦恩图得出交集靶点116个.其中核心靶点包括白细胞介素(Interleukin,IL)-6、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(Akt Serine/Threonine Kinase 1,AKT1)、IL-1B、基质金属蛋白酶(Matrix Metallopeptidase,MMP)9、肿瘤蛋白p53(Tumor Protein p53,TP53)、半胱氨酸蛋白酶3(Caspase 3,CASP3)等.根据KEGG分析,预测该药对主要通过癌症、晚期糖基化终末产物(Advanced Glycation End Products,AGE)-AGE受体(AGE Receptor,RAGE)、丝裂原活化蛋白激酶(Mitogen-activated Protein Kinase,MAPK)、IL-17等信号通路发挥对慢性心力衰竭的治疗作用.分子对接结果显示,药对中的有效活性成分槲皮素、木犀草素与筛选得出的核心靶点IL-6、TNF有较好的对接活性.结论:丹参-淫羊藿药对可通过多成分、多靶点、多通路治疗慢性心力衰竭,为临床使用该药对治疗慢性心力衰竭提供了理论依据,同时为探索慢性心力衰竭的潜在治疗方法提供了新思路.
文献关键词:
慢性心力衰竭;丹参;淫羊藿;网络药理学;分子对接
作者姓名:
刘辉;戴小华
作者机构:
安徽中医药大学第一附属医院,安徽 合肥,230000
文献出处:
引用格式:
[1]刘辉;戴小华-.基于网络药理学和分子对接探讨丹参-淫羊藿药对治疗慢性心力衰竭的作用机制)[J].中医临床研究,2022(32):8-14
A类:
Metallopeptidase
B类:
网络药理学,分子对接,丹参,淫羊藿,药对,慢性心力衰竭,利用网络,系统药理学,分析平台,TCMSP,Uniprot,Disgenet,DrugBank,GeneCards,靶点基因,Venny,中药活性成分,STRING,蛋白质相互作用网络,Cytoscape,核心靶点,Metascape,在线分析工具,交集靶点,基因本体论,京都基因和基因组百科全书,富集分析,生信,作图,AutodockTools,主要活性成分,Pymol,两味,作用靶点,韦恩图,Interleukin,Tumor,Necrosis,Factor,丝氨酸,苏氨酸蛋白激酶,Akt,Serine,Threonine,Kinase,AKT1,1B,基质金属蛋白酶,Matrix,MMP,p53,Protein,TP53,半胱氨酸蛋白酶,Caspase,CASP3,该药,晚期糖基化终末产物,Advanced,Glycation,End,Products,Receptor,RAGE,丝裂原活化蛋白激酶,Mitogen,activated,MAPK,治疗作用,槲皮素,木犀草素,选得,接活,多成分,多靶点,多通路,临床使用,潜在治疗
AB值:
0.365511
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