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普通烟草热激转录因子家族的全基因组鉴定与分析
文献摘要：
热激转录因子(heat shock transcription factor,Hsf)家族成员广泛参与植物生长发育和非生物胁迫的调控.本研究应用生物信息学和比较基因组学方法从普通烟草中鉴定了49个Hsf家族成员,发现这些Hsf家族成员均具有较为保守的寡聚化结构域.通过系统进化分析可将烟草和拟南芥的Hsf家族成员划分成3个分支与14个亚家族.共线性分析显示烟草Hsf基因与双子叶植物(拟南芥,番茄和葡萄)Hsf基因组成共线基因对的数量要大于与单子叶植物(水稻和玉米)Hsf基因组成共线基因对的数量.全基因组复制预测共有12个NtHsf基因可组成7条复制基因对.启动子分析发现NtHsf基因启动子区域存在着多个与非生物胁迫相关的顺式作用元件.表达模式分析证实NtHsf家族成员在不同组织的表达具有差异,并且大多数NtHsf家族成员可响应热和干旱胁迫.研究结果可为烟草Hsf转录因子家族成员的功能研究奠定生物信息学基础.
文献关键词：
普通烟草;热激转录因子;共线性;全基因组复制;表达模式
中图分类号：
作者姓名：
郭存;王奇;李晓旭;张震彪;文利超;邓智超;初雨蒙;刘涛;崔萌萌;郭永峰
作者机构：
中国农业科学院烟草研究所,烟草行业基因资源利用重点实验室,青岛 266101;中国农业科学院研究生院,北京 100081;湖南中烟工业有限责任公司技术中心,长沙410007
文献出处：
引用格式：
[1]郭存;王奇;李晓旭;张震彪;文利超;邓智超;初雨蒙;刘涛;崔萌萌;郭永峰-.普通烟草热激转录因子家族的全基因组鉴定与分析)[J].中国烟草科学,2022(03):47-56
A类：
Hsf,NtHsf
B类：
普通烟草,热激转录因子,全基因组鉴定,heat,shock,transcription,植物生长发育,非生物胁迫,研究应用,比较基因组学,寡聚化,结构域,系统进化分析,拟南芥,亚家族,共线性分析,双子叶,番茄,单子叶植物,水稻,全基因组复制,复制基因,启动子分析,基因启动子区,启动子区域,顺式作用元件,表达模式分析,不同组织,干旱胁迫,功能研究
AB值：
0.22907
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