典型文献
茶网蝽线粒体基因组全序列测定及系统发育分析
文献摘要：
为明确茶网蝽(Stephanitis chinensis)线粒体基因组序列特征,探究其系统发育地位.利用Illumina和Sanger测序对陕西省安康市茶网蝽线粒体基因组进行测定.结果显示,茶网蝽线粒体基因组全长18085 bp,包含37个基因(13个蛋白质编码基因,22个tRNA,2个rRNA)和1个3678 bp的控制区,基因排列与昆虫线粒体祖先基因顺序(Ancestral gene order)相同.基因组AT含量为78.10％.13个蛋白质编码基因中,6个以ATG起始,7个以ATT或ATA起始,10个以TAA或TAG为终止密码子,cox2、atp6和cox3以T终止,蛋白质编码基因使用频率最高的密码子是UUA、AUU、UUU和AUA,使用频率最高的氨基酸为亮氨酸(Leu)、异亮氨酸(Ile)、苯丙氨酸(Phe)和丝氨酸(Ser).22个tRNA基因存在GU、UU、GA和AA错配23处,trnS1(GCU)缺少DHU臂,其他tRNA均能形成典型三叶草结构.控制区包含位于前端的3种非串联重复、4个(TTAG)n和1个位于后端的串联重复序列,含有多个茎环结构.系统发育分析结果表明,茶网蝽与直脊冠网蝽(Stephanitis mendica)的亲缘关系最近,所有网蝽科聚为一簇,位于发育树的根部.
文献关键词：
茶网蝽;线粒体基因组;序列分析;系统发育
中图分类号：
作者姓名：
杨金宏;谢满超;文欣茹;陈蕊茹;孔卫青
作者机构：
安康学院现代农业与生物科技学院/陕西省茶叶省市共建重点实验室,陕西 安康 725000;安康学院陕西省蚕桑重点实验室,陕西 安康 725000
文献出处：
引用格式：
[1]杨金宏;谢满超;文欣茹;陈蕊茹;孔卫青-.茶网蝽线粒体基因组全序列测定及系统发育分析)[J].茶叶科学,2022(06):839-850
A类：
茶网蝽,Stephanitis,TTAG,mendica
B类：
线粒体基因组,全序列测定,系统发育分析,chinensis,基因组序列,序列特征,Illumina,Sanger,陕西省安康市,市茶,基因组全长,bp,蛋白质编码基因,tRNA,rRNA,控制区,昆虫,祖先,Ancestral,gene,order,ATG,ATT,ATA,TAA,终止密码子,cox2,atp6,cox3,使用频率,UUA,AUU,UUU,AUA,Leu,异亮氨酸,Ile,苯丙氨酸,Phe,丝氨酸,Ser,GU,GA,错配,trnS1,GCU,DHU,三叶草,个位,后端,串联重复序列,茎环结构,亲缘关系,蝽科,一簇,发育树,根部,序列分析
AB值：
0.414083
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